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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 【活动】Gaussian的FAQ答案征集开始啦，回答者均有金币拿！
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by clwg at 2009-10-7 20:41:
(1.1)Gaussian不是免费的
（1.2）Gaussian在此处就可以下载
（1.4）只要能做出东西就可以发文章

谁跟你说的只要能做出东西就可以发文章??你要买版权！
都21世纪了，版权意识怎么还这么差
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51楼2009-10-07 21:14:02
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qiangwxr

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
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lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 10-9 21:20
（2.3） 答
问题：scf不收敛怎么办？几何优化不收敛怎么办？

已经有了最佳答案，也从答案中学到不少东西。想补充一点。这几天碰到了这个问题：
花了一个晚上，几何优化了150次，还没有收敛（scf收敛没问题），报l9999错误。
根据Materials Studio的DMol3结构优化经验，减小收敛精度。原来的部分输入文件：
#p RHF/B3LYP/Integral(Grid=UltraFine)/6-31G
SCF=(MaxCycle=100,Tight)
OPT=(Redundant,MaxCycle=100,MaxStep=29,VeryTight)
修改为：
#p RHF/B3LYP/Integral(Grid=FineGrid)/6-31G
SCF=(MaxCycle=100)
OPT=(Redundant,MaxCycle=100,MaxStep=29,Loose)
几分钟就成功结束。然后将输出文件中的原子坐标代入输入文件，增加收敛精度，重新计算。
这样应该能解决初始结构离平衡点较远等问题。
接触Gaussian时间很短，也不知道有没有道理。

[ Last edited by qiangwxr on 2009-10-10 at 10:36 ]
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52楼2009-10-07 23:01:22
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zxyan

至尊木虫 (文坛精英)
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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-9 21:20
4.3）
一看见量化书里那些公式就头大，没兴趣学下去了。我该怎么办？
后续问题：我以前是做实验的，理论化学的东西太难了，没信心了，帮帮我吧
后续问题：我不想学理论，我只想学学软件操作，行吗？
如果不想学习量化书籍，就要看相关的文献(中英文都要看!)，当然这种方法比较直接实用。可以解决眼前问题，长期来说还是要看量化书籍，那样知识较为系统。如果不学理论只学软件操作，对计算结果的解释将难以做到系统深刻，或许可以简章解释你的实验结果，要想走很远较难。理论难学是暂时的，多看几遍就理解了!
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53楼2009-10-08 08:17:52
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-10 09:56
引用回帖:
Originally posted by qiangwxr at 2009-10-7 23:01:
（2.3） 答
问题：scf不收敛怎么办？几何优化不收敛怎么办？

已经有了最佳答案，也从答案中学到不少东西。这几天碰到了这个问题：
花了一个晚上，几何优化了150次，还没有收敛（scf收敛没问题），报I9999错误 ...

哦，有个小问题。这不是I9999错误，而是L9999错误。你把小写的L当成了大写的I了。事实上，这个L是Link的缩写
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54楼2009-10-08 09:06:28
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castep

木虫 (著名写手)
★ ★
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 10-25 21:27
我不懂多重度说的单电子的判断

我计算 负一价HSO4,我的多重度应该是多少呀?
还有正一价的咪坐,多重度是多少?
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多多交流！
55楼2009-10-09 20:41:47
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-10 09:57
引用回帖:
Originally posted by castep at 2009-10-9 20:41:
我不懂多重度说的单电子的判断

我计算 负一价HSO4,我的多重度应该是多少呀?
还有正一价的咪坐,多重度是多少?

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
看第2章第5节
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56楼2009-10-10 09:05:57
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+4,VIP+0):谢谢关于高斯的安装过程。但是我没看见ADF啊 10-11 13:29
新增问题（1.5）Gaussian如何在Linux下安装？
答：安装软件g03 和adf
   ftp 212.198.133.204 ，输入用户名和密码之后进入另一服务器，以获得软件源文件
   get g03_d01.tar.gz  复制传输 g03
   bye 退出ftp，回到本机（也可以直接从本地用FTP拖到Linux上）
   解压g03：tar –xvzf g03_d01.tar.gz
，生成g03目录。在根目录下(即cd ~ 可进入)，vi .bashrc 添加几行字以设置环境变量
       # Gaussian 03 setup 2009-6-13 说明行
       export g03root=/home/ifmc
          source $g03root/g03/bsd/g03.profile
          #end
保存退出(wq!)，并source  .bashrc 启用此更改,即刷新。

找一个g03的输入文件测试 软件是否安装完好
如上，进入另一服务器，先敲入 ascii转化到ascii格式，在选取*.gjf文件，传输到本机
回到本机，修改输入文件，nproc=4 mem=3333Mb （此时4核并用），在命令行执行g03任务
如不能运行，vi  ./etc/rc.d/rc/local ，在其中填入一句话
               echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_vol_space

设置g03 权限：chmod +x g03

建立新用户（在root下建立）：
Adduser –g ifmc tttt  表示在ifmc组下建立其他用户tttt（在一个组下建立用户便于管理，并且不至于混乱）
Passwd  ttt 输入两次密码就ok了。
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57楼2009-10-11 12:16:53
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)
哦， 一会加上
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58楼2009-10-11 13:52:57
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wuy069

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+3,VIP+0):感谢参与交流 10-11 16:33
ADF的安装(以ADF2008.1e hpmpi版为例
root
tar –zxvf adf2008.01e.linux.*.tgz
mv adf2008.01 /home/
chmod 750 –R adf2008.01
cd /home/
cp license adf2008.01/
mkdir adf2008.01/ADF scratch
chmod 750 –R ADF scratch

vi /etc/profile
export ADFHOME=/home/adf2008.01
export ADFBIN=/home/adf2008.01/bin
export ADFRESOURCES=/home/adf2008.01/atomicdata
export SCMLICENSE=/home/adf2008.01/license
export NSCM=4
export SCM_TMPDIR=/home/adf2008.01/ADFscratch

source /etc/profile
reboot
chmod +x filename.e                ./filename.e >filename.o&
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59楼2009-10-11 13:55:04
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shengxiaohong

至尊木虫 (知名作家)

实验员
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-25 21:28
引用回帖:
Originally posted by castep at 2009-10-9 20:41:
我不懂多重度说的单电子的判断

我计算 负一价HSO4,我的多重度应该是多少呀?
还有正一价的咪坐,多重度是多少?

多重度应该选1.如果体系的电子为偶数多重度应该选1,3,5,如果再有是有机分子或没有金属或过渡金属,选1就可以了,如果体系的电子为基数,多重度应该选2,4,6...,如果再有是有机分子或没有金属或过渡金属,选2就可以了.
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谌晓洪
60楼2009-10-25 18:15:11
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