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limingtiaan2

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 水分子上氢原子

CIF 检测时,发现有A、B级错误,费了很长时间都没有弄好,期待高手指点。
Alert level A
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H5D    ..  H6B     ..       1.60 Ang.
PLAT482_ALERT_4_A Small D-H..A Angle Rep for O6     ..  O5      ..      13.00 Deg.
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      122.00, Rep       13.00 Dev...     109.00 Deg.
              O6   -H6B  -O5      1.555   1.555   1.555                        

PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O6     -   H6A    ...          ?   
后来进行精修,发现H2O 分子位于三重轴上,即O6和H6A都是在轴上。当继续加氢时,H6B,grow后发现水分子上面有4个氢原子,所以肯定是错误的,但是不加H6B时,grow后只有1个氢原子,所以也是不对的。所以请教高手,如何加氢。
谢谢!


[ Last edited by limingtiaan2 on 2009-9-22 at 09:37 ]
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永远有多远?没有答案,海枯石烂!
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wwt1806

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by monoclinic at 2009-9-21 15:51:
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D   H5D ..  H6B ..   1.60 Ang.
H5D、H6B里面至少有一颗H的位置不合适,或者两颗都不合适,H5D..H6B距离太短。

PLAT482_ALERT_4_A Small D-H..A Angle Rep for O6    ...

那么怎么才能修改好中间的这两个A错误呢?
鲲鹏展翅行千里,他日无风假何物?
3楼2009-09-21 21:20:42
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