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zrcrong金虫 (小有名气)
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【求助】计算基团间相互作用能
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请问一下各位，如何用Gaussian03计算不同分子间的相互作用能或者不同基团的相互作用能？ 谢谢大家！ |
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2楼2009-09-20 09:36:23
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3楼2009-09-20 12:25:01
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（1）结构优化： 两个水分子相互作用（以氢键作用为主）,经过测试（JPCA，2007，10439-10452），mpw3lyp/mg3s在结构优化中取得了最好成绩。 如何在高斯03中实现mpw3lyp呢？ #mpwlyp/6-31+G(d,p) iop(3/76=1000002000) iop(3/77=0720008000) iop(3/78=0810010000) 两个稀有气体分子之间的作用（范德华力作用为主），b97-1/mg3s在结构优化中取得了最好成绩。 b97-1在高斯03的泛函列表中存在。 （2）结合能计算 用氢键组建的dimer的结合能计算，b97-1/mg3s取得了最优成绩 用氢键组建的含有pi 体系的dimer的结合能计算，pwb6k/mg3s取得了最优成绩 用范德华力组建的dimer的结合能计算，b97-1/mg3s和b97-1/didz/aug-cc-pvtz/mg3s，对不同体系均取得了不错的成绩。m05-2x/aug-cc-pvtz精度稍差。 注1：Gaussian E01版实现了m05-2x。 注2：下载一个Minnesota Gaussian Functional Module（免费的），将它安装进Gaussian D01或E01版中，就能实现pwb6k。 Gaussian中没有mg3s基组，要自己手工输入 讲述结束，斑竹给钱！敲了好多字啊 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-9-20 at 21:27 ] |
7楼2009-09-20 15:24:45
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这个……要查文献才行的！ 如果实在不想查文献，短程作用（化学键的作用力），B3LYP（结构）+MPn（跑单点算轨道）+PBE1PBE（配合NBO算电子布局），就是很通用的选择。结果总不会太差。 注意，B3LYP处理长程作用很不理想 基组嘛，如果也实在不想查文献，劈裂价键基组+赝势基组（LanL2DZ或SDD）就能解决绝大部分问题 其实，最好的选择，往往是你读了大量文献，才能得到的。 B3LYP，MPn，PBE，劈裂价键基组，LanL2DZ，SDD……这些通用的东西，确实是不错的，但一般来说不是最优的。这也是通用方法的局限性——普适性+低精度。而专用的方法，虽然可以得到很高的精度，但是往往不具有普适性 |
9楼2009-09-20 21:18:56
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这也让我们对基组是通用性&专用性产生了疑问。 这个问题见楼上 现在又要请教大侠们了。一是高斯中包含的基组有限，其说明书或手册中并未对其进行分类。若是带电荷基团间相互作用应该用什么方法和基组？ 这个我没法直接说，“带电荷基团”太广泛了，明确些！ LS介绍的基组大多并非高斯自带的。 别以为高斯是万能的，切切！高斯不是百科全书，自己要发挥主动性 若菜鸟们要计算一个体系通过检索无相关文献，属新计算体系，那又应如何确定用何基组效果和精度最好？依据是什么？ 我就不信没有类似的体系被计算过！如果你真的计算了一个体系，连类似的都没有，那么恭喜你——你要投N或S了。呵呵，开个玩笑 |
10楼2009-09-20 21:33:35
