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yangliguo

金虫 (小有名气)

无所畏惧

[交流] 求助晶体错误解决方案！！！！

这些晶体错误是什么意思？怎样取消这些错误！！
Alert level A
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C1     --  C2      ..       1.81 Ang.
PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing ..          ?
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed     
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
PLAT721_ALERT_1_A Bond    Calc     0.86000, Rep     0.97000 Dev...       0.11 Ang.
              C27' -H27D    1.555   1.555                                      
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      103.00, Rep     109(10) Dev...       6.00 Deg.
              CL3' -C27' -CL2'    1.555   1.555   1.555                        
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      104.00, Rep      109.90 Dev...       5.90 Deg.
              CL2' -C27' -H27C    1.555   1.555   1.555                        
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      113.00, Rep      109.90 Dev...       3.10 Deg.
              CL3' -C27' -H27D    1.555   1.555   1.555                        
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      119.00, Rep      108.30 Dev...      10.70 Deg.
              H27C -C27' -H27D    1.555   1.555   1.555                        
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      107.00, Rep      109.90 Dev...       2.90 Deg.
              CL3' -C27' -H27C    1.555   1.555   1.555                        
--------------------------------------------------------------------------------Alert level C
RINTA01_ALERT_3_C  The value of Rint is greater than 0.12
            Rint given   0.155
PLAT020_ALERT_3_C The value of Rint is greater than 0.12 .........       0.16      
PLAT026_ALERT_3_C Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....         41 Perc.
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Zn1    --  P1      ..       6.83 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Zn1    --  Cl1_a   ..       5.41 su   
PLAT341_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         11      
PLAT120_ALERT_1_C Reported SPGR ?       Inconsistent with Explicit      C2/c      
PLAT194_ALERT_1_C Missing _cell_measurement_reflns_used datum ....          ?
PLAT195_ALERT_1_C Missing _cell_measurement_theta_max   datum ....          ?
PLAT196_ALERT_1_C Missing _cell_measurement_theta_min   datum ....          ?
--------------------------------------------------------------------------------Alert level G
PLAT343_ALERT_2_G Check         Angle Range in Main Residue for ..        C1      
PLAT343_ALERT_2_G Check         Angle Range in Main Residue for ..        C2      
PLAT302_ALERT_4_G Note: Anion/Solvent Disorder ...................      25.00 Perc.
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1楼 2009-09-19 09:21:47
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美丽预言

金虫 (正式写手)
不知道怎么回事，是不是因为晶体里面包含杂质啊
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2楼2009-09-19 14:59:34
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-19 15:51
yangliguo(金币+5,VIP+0):谢谢！就是如何改变氢键的连接，或者操作代码啊？ 9-19 17:32
Alert level A
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C1     --  C2      ..       1.81 Ang.
C-C键太长，不符合常规
需要限制
PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing ..          ?
输入你所用的吸收矫正方法
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed   
吧mixed改为constr  
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
吧空间群在此处输入

以下的错误是同一个原因造成的，可能是氢键加错了或者操作代码不对
PLAT721_ALERT_1_A Bond    Calc     0.86000, Rep     0.97000 Dev...       0.11 Ang.
              C27' -H27D    1.555   1.555                                      
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      103.00, Rep     109(10) Dev...       6.00 Deg.
              CL3' -C27' -CL2'    1.555   1.555   1.555                        
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      104.00, Rep      109.90 Dev...       5.90 Deg.
              CL2' -C27' -H27C    1.555   1.555   1.555                        
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      113.00, Rep      109.90 Dev...       3.10 Deg.
              CL3' -C27' -H27D    1.555   1.555   1.555                        
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      119.00, Rep      108.30 Dev...      10.70 Deg.
              H27C -C27' -H27D    1.555   1.555   1.555   
                     
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      107.00, Rep      109.90 Dev...       2.90 Deg.
              CL3' -C27' -H27C    1.555   1.555   1.555   
C类错误没必要处理
赞一下(11人) 回复此楼
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
3楼2009-09-19 15:05:32
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 美丽预言 at 2009-9-19 14:59:
不知道怎么回事，是不是因为晶体里面包含杂质啊

PS单晶肯定是100%纯物质
赞一下 回复此楼
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
4楼2009-09-19 15:06:04
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yangliguo

金虫 (小有名气)

无所畏惧
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2009-9-19 15:05:
Alert level A
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C1     --  C2      ..       1.81 Ang.
C-C键太长，不符合常规
需要限制
PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing  ...

你能不能帮我解决一下，我不会弄！谢谢！你给我邮箱，你帮我弄一下，行吗？
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付出总有回报！
5楼2009-09-20 18:42:06
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