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大力2010

金虫 (著名写手)

[求助] 哪种结构搜索程序比较容易入门，求推荐 已有1人参与

哪种结构搜索程序比较容易入门，求推荐
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1楼 2023-02-13 22:41:32
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paramecium86

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2023-02-14 13:59:34
构象搜索程序么？  一般是用 1. 单键旋转的穷举搜索法 基于这种算法的有spartan(收费，老版本能搜到不可描述版）  gmmx （ GaussView的插件。收费。操作简单）  pcmodel10（ 免费， 基本和gmmx用相同的算法，兼容高斯的输入输出文件） conflex （收费）openbabel （遗传算法，免费） 2. 基于分子动力学 代表性的有xtb+crest做 metadynamics    或者用xtb直接跑动力学搭配molclus（流程见sob的帖子。https://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html  ）

我教程（1.6版本）的附录里比较了几种构象搜索算法以及简单的操作流程。https://muchong.com/t-14242735-1


以上是单分子的构象搜索。如果是需要多分子组合成团簇来搜索结构那可以尝试张鋆老师的

abcluster

https://bbs.keinsci.com/thread-26088-1-1.html
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2楼2023-02-14 09:28:26
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大力2010

金虫 (著名写手)
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3楼2023-02-14 21:27:20
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大力2010

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4楼2023-02-17 22:31:23
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大力2010

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5楼2023-02-17 22:43:05
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 大力2010 at 2023-02-17 09:43:05
我想用 USPEX  ，好像要有USPEX脚本 ，要知道被预测结构的体积，脚本和体积怎样得到，求指点。  这是使用说明：https://blog.sciencenet.cn/blog-567091-837003.html...

USPEX这就是晶体类的结构搜索了。这种就比较适合去第一性原理板块问了。给你把帖子移过去了。
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6楼2023-02-18 09:32:25
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