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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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王饭饭_

新虫 (初入文坛)

[求助] namd上生成psf文件时候拓扑文件操作失误,请前辈指点

分子动力学模拟小白,老师给的任务是建一个甲醇溶液盒子,在namd上实现拉伸测试。我用ms建了一个甲醇模型导出为pdb文件,packmol实现了一个多分子溶液,在namd上生成psf文件时候拓扑文件操作失误,不知道对应的名称如何改?还是要自己生成一个top文件?
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别灰心,困难总比办法多。。。
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