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sin81

金虫 (正式写手)

[求助] VASP并行效率太慢已有4人参与

新编译的vasp5.4 并行运算速度很慢。服务器cpu是: Intel(R) Xeon(R)Gold 8375C 2.90GHz,Turbo 3.50GHz,内存96G。与另外一台服务器,配置为:Intel(R) Xeon(R) E5-2640 v3 @ 2.60GHz, 96G内存的对比,原子数少的体系,所耗时间大概是2-3倍,原子数多的,就更慢,大概在15-20倍。请问这是怎么回事?

请问,这种问题可能的原因是什么?是服务器配置占主要还是编译VASP的过程占主要?比如用的编译的的数学库的问题?

编译用的Intel2016, 用的是mpiifort编译的。
老的服务器:
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rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by sin81 at 2023-02-04 18:42:37
请问在哪儿设置?...

Compilers        Flags for Knights Landing (KNL)        Flags for Skylake (SKX)
Intel icc or ifort        -O3 -xMIC-AVX512        -O3 -xCORE-AVX512 -qopt-zmm-usage=high
GNU gcc or gfortran        -O3 -march=knl        -O3 -march=skylake-avx512
8楼2023-02-06 00:05:25
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大懒猫王浩

金虫 (著名写手)

学渣

看有没有可能是节点间通讯问题。

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

一步一步往上走,,,,
2楼2023-01-29 13:17:56
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sin81

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 大懒猫王浩 at 2023-01-29 13:17:56
看有没有可能是节点间通讯问题。

请问如何查看?
3楼2023-01-30 10:32:17
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

1、如果你是单节点计算的话,按道理不会是节点通讯问题。
2、看看NCORE或者NPAR设置是否合适,以及计算每个核心负载情况(top命令看看)。
4、看看输出文件OUTCAR的信息是否是真的在mpi并行,还是mpi同时做了多个相同的计算。
3、96核心并行效率是会下降一些,也不至于这么多。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2023-01-31 18:32:30
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