应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP并行效率太慢
101/1返回列表
查看: 1751  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者sin81将赠送您 10 个金币

sin81

金虫 (正式写手)

[求助] VASP并行效率太慢 已有4人参与

新编译的vasp5.4 并行运算速度很慢。服务器cpu是： Intel(R) Xeon(R）Gold 8375C 2.90GHz,Turbo 3.50GHz，内存96G。与另外一台服务器，配置为：Intel(R) Xeon(R) E5-2640 v3 @ 2.60GHz， 96G内存的对比，原子数少的体系，所耗时间大概是2-3倍，原子数多的，就更慢，大概在15-20倍。请问这是怎么回事？

请问，这种问题可能的原因是什么？是服务器配置占主要还是编译VASP的过程占主要？比如用的编译的的数学库的问题？

编译用的Intel2016， 用的是mpiifort编译的。
老的服务器：
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2023-01-29 08:52:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

大懒猫王浩

金虫 (著名写手)

学渣
看有没有可能是节点间通讯问题。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

sin81
一步一步往上走，，，，
2楼2023-01-29 13:17:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sin81

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 大懒猫王浩 at 2023-01-29 13:17:56
看有没有可能是节点间通讯问题。

请问如何查看？
回复此楼
3楼2023-01-30 10:32:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
1、如果你是单节点计算的话，按道理不会是节点通讯问题。
2、看看NCORE或者NPAR设置是否合适，以及计算每个核心负载情况（top命令看看）。
4、看看输出文件OUTCAR的信息是否是真的在mpi并行，还是mpi同时做了多个相同的计算。
3、96核心并行效率是会下降一些，也不至于这么多。
赞一下(2人) 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2023-01-31 18:32:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyikeco

木虫 (正式写手)

newbie

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
- restart the server
- recompile VASP
- restart the server
- start VASP
赞一下 回复此楼
5楼2023-02-01 00:48:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖

FLAFG 设置的话  8375C可以试试AVX512
赞一下 回复此楼
路漫漫其修远兮
6楼2023-02-02 22:17:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sin81

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hs0218 at 2023-02-02 22:17:04
FLAFG 设置的话  8375C可以试试AVX512

请问在哪儿设置？
赞一下 回复此楼
7楼2023-02-04 18:42:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rlafite

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by sin81 at 2023-02-04 18:42:37
请问在哪儿设置？...

Compilers        Flags for Knights Landing (KNL)        Flags for Skylake (SKX)
Intel icc or ifort        -O3 -xMIC-AVX512        -O3 -xCORE-AVX512 -qopt-zmm-usage=high
GNU gcc or gfortran        -O3 -march=knl        -O3 -march=skylake-avx512
赞一下 回复此楼
8楼2023-02-06 00:05:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sin81

金虫 (正式写手)
感谢各位大佬的帮忙和建议。问题解决了。是内存的问题。重新插拔了一下，发现有一个通道有问题。那个内存通道可能是插槽坏了，因为更换内存条也是不识别。拔掉那个通道的内存条，速度就提升上来了。缺憾是少了一个内存通道，两条，内存总量较低了。但速度还行。大多数不吃内存的计算都没问题。
赞一下 回复此楼
9楼2023-02-09 10:00:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by sin81 at 2023-02-09 10:00:56
感谢各位大佬的帮忙和建议。问题解决了。是内存的问题。重新插拔了一下，发现有一个通道有问题。那个内存通道可能是插槽坏了，因为更换内存条也是不识别。拔掉那个通道的内存条，速度就提升上来了。缺憾是少了一个内 ...

两颗gold cpu配置12条内存，速度更佳
赞一下 回复此楼
10楼2023-02-09 18:50:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sin81 的主题更新
101/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +5 慕寒mio 2026-03-16 5/250 2026-03-17 21:31 by hmn_wj
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +3 脱颖而出 2026-03-16 6/300 2026-03-17 21:19 by z1z2z3879
[考研] 材料与化工求调剂 +6 为学666 2026-03-16 6/300 2026-03-17 20:15 by peike
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +9 柴郡猫_ 2026-03-12 9/450 2026-03-17 10:18 by Sammy2
[考研] 11408 一志愿西电，277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 一志愿华中师范071000，325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 工科，求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂，科研和技能十分丰富，求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭