| 查看: 595 | 回复: 4 | ||
| 【奖励】 本帖被评价3次，作者紫色雅典娜增加金币 2.25 个 | ||
| 当前主题已经存档。 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[资源]
【资源】固定模型中的部分原子的方法
|
||
|
是从高斯群里对话整理而来，归功于妞妞！若有幸她能看到的话，我将所得全部金币赠给她！看不到的话，就归我了，哈哈……还请大家积极评分！ sunny(40181291) 15:11:18 我在网上没有找到固定模型中的部分原子的方法，所以到这里来请教各位，谁能给我说一下？ 小乐呵妞妞(632715412) 15:13:34 在分子说明后空行 要固定原子的序号 F sunny(40181291) 15:13:57 哦 sunny(40181291) 15:14:05 我试下 sunny(40181291) 16:17:40 想问下直接用view怎么固定原子啊？ sunny(40181291) 16:19:43 怎么操作 川大---信仰(826030268) 16:20:24 选项中选择FIXED sunny(40181291) 16:21:36 比方说A-B的键长，只能fix一个啊 sunny(40181291) 16:21:49 如果两个都固定就不行了吧 川大---信仰(826030268) 16:22:22 你想改键长都固定了怎么改啊！晕！ sunny(40181291) 16:22:45 固定健长 sunny(40181291) 16:22:53 两个原子都固定 川大---信仰(826030268) 16:23:11 那就选择键角了撒 小乐呵妞妞(632715412) 16:23:37 edit-redundant ...好像是这个，可以固定键长，键角，二面角，想固定哪个固定哪个 川大---信仰(826030268) 16:23:41 你不可能把每个原子都固定的， 川大---信仰(826030268) 16:24:12 什么好东东，给我传一个吧 sunny(40181291) 16:24:21 周边的原子固定，核心的原子优化 小乐呵妞妞(632715412) 16:24:40 就是在Gv中固定，我记不清了，好像是这个的 sunny(40181291) 16:25:37 嗯 有说可以的 但是我不会操作，我不知道是不是你说的那样，在设健长和键角的时候fixed 川大---信仰(826030268) 16:25:38 GV中能做优化吗？你用的什么版本啊？ sunny(40181291) 16:26:16 GV固定原子的操作，不可能做优化的 小乐呵妞妞(632715412) 16:26:23 GV只能建结构的，sunny不是在建结构的时候要固定原子吗 川大---信仰(826030268) 16:26:43 那你说的嘛！核心原子优化 sunny(40181291) 16:27:02 妞妞说的是我的意思 川大---信仰(826030268) 16:27:11 明白 sunny(40181291) 16:27:36 这个问题已经困惑了我好久了 川大---信仰(826030268) 16:27:46 这个真没有弄过，我听听高手的意见 小乐呵妞妞(632715412) 16:28:14 我刚才告诉你的路径，你从GV中进取看看 sunny(40181291) 16:28:38 我试过，但是gjf文件没发现区别 小乐呵妞妞(632715412) 16:28:44 里面就有几个选项，你先建一个简单的结构试一下就知道了 sunny(40181291) 16:29:47 在分子说明后空行 要固定原子的序号 F 这个是你刚才说的 小乐呵妞妞(632715412) 16:29:52 要在里面选好你要固定的原子，或者键长等，然后选Freeze coordinate就固定了 小乐呵妞妞(632715412) 16:29:59 是的 sunny(40181291) 16:30:03 我看了下高斯手册是有这个命令 sunny(40181291) 16:30:28 但是我的gjf文件里面原子没序号啊 小乐呵妞妞(632715412) 16:30:38 那个是自己在gjf文件后加的命令，适用于固定少数几个原子，如果固定的原子太多者格就麻烦了 sunny(40181291) 16:30:51 哦 这样啊 小乐呵妞妞(632715412) 16:31:10 序号可以从GV打开你的gjf文件来看啊 小乐呵妞妞(632715412) 16:31:30 右键-view-lable就能看了 小乐呵妞妞(632715412) 16:31:51 看好固定的原子的序号，按我上面的方法，就行了 小乐呵妞妞(632715412) 16:32:16 这次够详细了吧，呵呵 sunny(40181291) 16:32:48 好的 谢谢 我试下 sunny(40181291) 16:33:38 刚才你说的那个Freeze coordinate在哪里啊？还是要写进gjf啊？ 小乐呵妞妞(632715412) 16:37:19 你按照我说的路径来 打开GV-打开gjf文件——edit——redundant coordinate—— 在里面add你要固定的键长键角——在最下面的可选框中点下拉菜单 就看到Freeze coordinate了 这些地方自己随便点点就能找到的，我给你把路径敲出来了， 你自己多试试吧，自己建一个结构随便点就慢慢找到了 小乐呵妞妞(632715412) 16:39:04 说明一点，上面的GV中点选得方法和我说的在分子说明行后自己 添加是两种等价的固定原子的方法，选其中一种既可 sunny(40181291) 16:40:41 好的 十分感谢 [ Last edited by 紫色雅典娜 on 2009-9-17 at 10:22 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
中科院西安光机所——促进学术交流，推动产学研融合，分享领域成果，加强校企合作。
已经有0人回复
-
求助：三乙酰丙酮铁（Fe(acac)₃）标准红外(IR)与XRD谱图/数据
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有57人回复
-
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复
-
申请2027年材料/化学类博士
已经有6人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有37人回复
-
求相关合成条件
已经有11人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
，内容太多了。 4楼2009-09-17 18:33:56
★★★★★ 五星级,优秀推荐
★
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢！ 9-17 22:03
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢！ 9-17 22:03
|
感谢坚强温柔的雅典娜·纱织小姐整理群发言 不足之处：无关话语太多。精炼些吧！ 参看http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1408125 我已经退群了好久了。上次我整理群发言，已经是6月27号了，从6.28到今天，又过了2个多月了。呵呵，你帮忙整理这两个多月的发言好吗？金币大大的有！ [ Last edited by yjcmwgk on 2009-9-17 at 22:16 ] |
2楼2009-09-17 11:04:51
★ 一星级,一般
erylingjet(金币+0,VIP+0):版规，老大 9-17 22:03
|
学习中 [ Last edited by loovfnd on 2009-9-17 at 23:13 ] |
3楼2009-09-17 11:36:42
被我看到了哈哈，不过别紧张呵呵，我不要你的金币，所得金币都归你。
5楼2009-09-18 08:56:50
