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大可0507

新虫 (小有名气)

[求助] 有大佬做过微卫星标记吗,求助一个问题 已有1人参与

微卫星的这个序列重复次数与微卫星产物大小之间有必然的联系吗,有什么关系呢,望解答!如:(GT)14 bp大小 118-145之间,(GT)21 bp大小104-145,(AC)21bp大小326-367。

@hc-material @gyesang 发自小木虫IOS客户端
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大可0507

新虫 (小有名气)

3楼2023-04-10 21:48:14
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ZM_HNU

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

微卫星的这个序列重复次数与微卫星产物大小之间有一定联系。“(GT)14 bp大小 118-145之间,(GT)21 bp大小104-145,(AC)21bp大小326-367”的表述有一定问题。

一般讲得条带大小是指包含微卫星序列和微卫星侧翼序列的PCR。
如果该微卫星侧翼序列片段长度为A bp,那么这个PCR产物的条带大小应该是(A+2*n)bp,n代表GT的重复次数。

例如你讲得“(GT)14 bp大小 118-145之间”这个结果是不可能的,因为A是确定的,加上2*n最终也必然是偶数。
水产动物种质资源与种苗工程-加州鲈
2楼2023-04-03 18:08:35
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