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大可0507

新虫 (小有名气)

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[求助] 有大佬做过微卫星标记吗，求助一个问题已有1人参与

微卫星的这个序列重复次数与微卫星产物大小之间有必然的联系吗，有什么关系呢，望解答！如：(GT)14 bp大小 118-145之间，(GT)21 bp大小104-145，(AC)21bp大小326-367。

@hc-material @gyesang 发自小木虫IOS客户端

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1楼 2022-12-08 14:52:49

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ZM_HNU

银虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

微卫星的这个序列重复次数与微卫星产物大小之间有一定联系。“(GT)14 bp大小 118-145之间，(GT)21 bp大小104-145，(AC)21bp大小326-367”的表述有一定问题。

一般讲得条带大小是指包含微卫星序列和微卫星侧翼序列的PCR。
如果该微卫星侧翼序列片段长度为A bp，那么这个PCR产物的条带大小应该是（A+2*n）bp，n代表GT的重复次数。

例如你讲得“(GT)14 bp大小 118-145之间”这个结果是不可能的，因为A是确定的，加上2*n最终也必然是偶数。