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yulei198415
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[交流]
大虾，救命啊！！
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小弟对晶体外行 小弟最近对固定原子命令afix有些疑惑 小弟只知道固定cp环是用afix 59和afix 0，固定cp*环是用afix 109和afix 0， 固定phenyl环是用afix 66和afix 0。 但是我在在一本书上看到有AFIX 95和AFIX 106 我想请问大虾们，这个afix命令后面的数字是不是有什么意义啊？ hfix对不同类型原子加氢时后面接有固定的数字，那afix在固定不同类型环时是不是后面也接有固定的数字啊？ 不胜感激！！  |
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3楼2009-09-13 16:53:38
4楼2009-09-13 23:42:00
5楼2009-09-14 10:14:20
lzg0473
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6楼2009-09-14 10:37:18
lzg0473
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7楼2009-09-14 10:38:40
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之前看到你的帖子了，只是自己不太懂，所以没回，既然发消息问我，我就说两句，但不一定对。 PS：我的金币太少，回不了消息了，呵呵。 像afix这样的指令后面所跟的数字代表的是某一种已知基团的强制限制模式： 比如你说的若已知结构中有苯环，但由于分子振动或者数据不好等原因，苯环显示的不是平面结构，这样我们用：afix 66指令强行把原子限制为六圆环，后面的afix 0表示这一操作的完成。 同理其他的限制都一样的，后面的数字不同是针对不同的基团，至于那个代码对应那种集团我也记不住，你可以再查一下资料，或者看看你所看到的这个指令限制的是什么集团，以后可以直接用。 对于加氢是同样的道理，hfix后面的不同数字代表的给不同的基团加氢，比如给苯环加： 在ins中输入和hfix 43 c1 refine后会变为 c1 afix 43 h1 afix0 这样就加完了 对于不同类型的原子加氢的代码也不一样 我就知道这么多，全是个人理解，仅供参考 |
8楼2009-09-14 19:51:18
jason897
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9楼2009-09-22 16:04:11
50