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moyunzhi

铜虫 (小有名气)

[求助] SDS-PAGE电泳法,marker缺最大的两条带可能的原因? 已有1人参与

最近遇到很神奇的一个问题:
我在跑SDS-PAGE电泳时,marker一共8条带,但时跑出来时只有6条带,最大的两条带没有。
于是我购买了 制胶的kit,用kit制胶跑出来的也是6条带。 然后我就把同一管marker送到别的实验室帮忙也跑了一下,奇迹似乎出现了,别的实验室就能把
marker的完整条带都跑出来。
现在是在时懵的不行。难道时我人出了问题?
求各位有经验的大佬指点一下。感激!感激!感激!
(小木虫上传图片怎么回事?上传不了?一上传就卡死了。给不了图片啊,伤心,伤心。)
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小鸟游佑太

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
根据你的描述,marker本身是没有问题的,问题应该就出现在凝胶或者电泳上面。
至于在何种情况下,大分子量蛋白无法被分离出,我个人认为有两点:
1、电泳未结束,溴酚蓝带需要跑到凝胶底部
2、凝胶浓度选择不合适,应在你用的凝胶浓度基础上,浓度要低一些
2楼2022-09-06 09:26:31
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moyunzhi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小鸟游佑太 at 2022-09-06 09:26:31
根据你的描述,marker本身是没有问题的,问题应该就出现在凝胶或者电泳上面。
至于在何种情况下,大分子量蛋白无法被分离出,我个人认为有两点:
1、电泳未结束,溴酚蓝带需要跑到凝胶底部
2、凝胶浓度选择不合适 ...

感谢您的帮助,我可能还需要补充一下我跑胶时遇到的问题:1.我请别的实验室帮忙跑胶时是都是用的12%的分离胶,4%的浓缩胶;2.我跑浓缩胶时,电泳内槽buffer漏到外槽,我就补了buffer,但奇怪的是跑分离胶时,就不漏了。内槽液面液稳定。
不知道是不是这个“漏液”导致的结果?但是为啥跑到分离胶时又不漏液了呢?就很奇怪。百思不得其解。
3楼2022-09-07 08:52:02
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小鸟游佑太

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by moyunzhi at 2022-09-07 08:52:02
感谢您的帮助,我可能还需要补充一下我跑胶时遇到的问题:1.我请别的实验室帮忙跑胶时是都是用的12%的分离胶,4%的浓缩胶;2.我跑浓缩胶时,电泳内槽buffer漏到外槽,我就补了buffer,但奇怪的是跑分离胶时,就不漏 ...

根据你的描述,如果你不是后来把内外槽的buffer液面补充到相同高度,我做一个猜想,浓缩胶漏液,而分离胶不漏液,这个说明,漏液问题应该不是胶板装夹问题导致的,应该是从胶板内漏出去的,可能是浓缩胶一开始和玻板之间有缝隙,在之后,凝胶不断吸水膨胀,使得凝胶与板子贴合更紧密,因此,后面就不漏液了,从这个猜想去分析大分子蛋白消失的问题,可能是大蛋白在后面因为凝胶和胶板的缝隙跑丢了。
       解决方法:为了解决玻璃板和凝胶的缝隙问题,需要注意几点,1、凝胶配置好需要立即使用,防止凝胶干缩;2、玻璃板需要清洗干净,不能有任何污渍;3、凝胶的速凝剂比例要选择合适
4楼2022-09-07 11:05:44
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moyunzhi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小鸟游佑太 at 2022-09-07 11:05:44
根据你的描述,如果你不是后来把内外槽的buffer液面补充到相同高度,我做一个猜想,浓缩胶漏液,而分离胶不漏液,这个说明,漏液问题应该不是胶板装夹问题导致的,应该是从胶板内漏出去的,可能是浓缩胶一开始和玻 ...

谢谢您的帮助,我后来把胶提前放水里泡了一会儿,还是有点漏,反正就是反复弄,终于没有怎么漏了,胶的浓度我也降到了10%,今天跑了一下,marker的第二条大带也看见了,但是最大的那条没有看见,考染明天看结果如何。
非常感谢!
5楼2022-09-08 21:34:52
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