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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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angellyq

木虫 (正式写手)

[交流] cif 检查总出错的地方

我在cif中编辑了一个氢键表,其中的参数是由platon 算出来的
loop_
    _geom_hbond_atom_site_label_D
    _geom_hbond_atom_site_label_H
    _geom_hbond_atom_site_label_A
    _geom_hbond_distance_DH
    _geom_hbond_distance_HA
    _geom_hbond_distance_DA
    _geom_hbond_angle_DHA
    _geom_hbond_site_symmetry_A
    C16 H16A O2A  0.93 2.578 3.499(2) 171 4_585

可是在提交检查的时候,总是报错,如下
Alert level C
PLAT716_ALERT_1_C H...A   Unknown or Inconsistent Label ..........        O2A     
                    H16A   O2A                                                
PLAT717_ALERT_1_C D...A   Unknown or Inconsistent Label ..........        O2A     
                    C16    O2A                                                
PLAT718_ALERT_1_C D-H..A  Unknown or Inconsistent Label ..........        O2A     
                    C16    H16A   O2A      

O2A的表示形式是在XP中用envi 指令找到的,到底怎么了?请高手指点啊,着急!
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413565631

银虫 (正式写手)

★ ★ ★
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 9-11 21:56
angellyq(金币+1,VIP+0):不错的提醒哦! 9-11 23:07
angellyq(金币+1,VIP+0):不错的提醒哦! 9-11 23:07
H键一般在LST文件中能找到
2楼2009-09-11 18:41:02
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monoclinic

木虫 (小有名气)

★ ★
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 9-11 21:57
angellyq(金币+1,VIP+0):很好的提醒,值得一试! 9-11 23:06
指的是原子标记不正确

仔细检查,有没有全角编码的字符

[ Last edited by monoclinic on 2009-9-11 at 19:28 ]
3楼2009-09-11 19:24:38
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dpzhang

木虫 (正式写手)

你好

★ ★
angellyq(金币+1,VIP+0):好的,试试看! 9-12 10:17
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-12 22:37
氢键在ins中加上命令,在list中产生。然后对于有些氢键要从list中找到对称操作码,写到ins中,精修,就会产生在cif中了
生活还要继续
4楼2009-09-12 08:08:52
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yy0520yy

金虫 (职业作家)

★ ★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-13 20:19
angellyq(金币+1,VIP+0):嗯,O2就可以,只是我的对称操作码写错了,呵呵 9-14 10:11
O2就可以了!!!
5楼2009-09-13 16:58:55
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