应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 均方位移曲线问题
51/1返回列表
查看: 1943  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者灵山在汝心将赠送您 100 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

灵山在汝心

新虫 (小有名气)

[求助] 均方位移曲线问题

各位前辈，想请教一下，我在Materials studio中计算均方位移曲线，准备用同一个初始结构计算多次曲线求平均值，但是为什么同一个初始结构在第一次NPT后得到了图一，第二次NPT后得到了图二，为什么有这么大的差距呢？怎么才能得到更为准确的均方位移曲线呢？NPT各个参数均是一样的。

均方位移曲线问题
图一


均方位移曲线问题-1
图二
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2022-08-02 19:16:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵山在汝心

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 灵山在汝心 at 2022-08-05 11:55:43
您好，我了解到可能是没有设置周期性边界条件的原因，想请教一下前辈MS中无定形晶胞怎么设置周期性边界条件的？
...

不好意思，搞错了，好像默认就是周期性的，但我问了一下师兄，他说可能是:模型没有调整成分子链完整，导致分子链越过边界后会有跳跃的情况，请问这种能否在MS中设置？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2022-08-05 12:21:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

灵山在汝心

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-08-03 08:58:23
NVT

我看到有人说NVT更好一点，但是我这个是按照一个文献做的算例，他用的NPT，就是想请教一下完成这个的原因是什么？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2022-08-03 10:23:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天天进步啊

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 灵山在汝心 at 2022-08-03 10:23:48
我看到有人说NVT更好一点，但是我这个是按照一个文献做的算例，他用的NPT，就是想请教一下完成这个的原因是什么？
...

算气体的MSD，才用NPT
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

灵山在汝心
分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
4楼2022-08-03 11:03:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵山在汝心

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-08-03 11:03:24
算气体的MSD，才用NPT...

我的就是气体啊，氢气

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2022-08-03 12:21:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 9/450 2026-11-15 02:04 by xSrQNSSjcgoX
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-15 00:27 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-15 00:24 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-14 22:44 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-14 22:39 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-14 22:04 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-14 21:58 by Equinoxhua
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 5/250 2026-11-13 11:15 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-13 11:08 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 9/450 2026-11-13 11:02 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 7/350 2026-11-13 10:55 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:09 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:36 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:27 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 10:03 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 11/550 2026-11-12 09:57 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:32 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 3/150 2026-11-12 08:26 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 5/250 2026-11-12 08:15 by HajghKOMynmz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭