应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 均方位移曲线问题
51/1返回列表
查看: 1511  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者灵山在汝心将赠送您 100 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

灵山在汝心

新虫 (小有名气)

[求助] 均方位移曲线问题

各位前辈，想请教一下，我在Materials studio中计算均方位移曲线，准备用同一个初始结构计算多次曲线求平均值，但是为什么同一个初始结构在第一次NPT后得到了图一，第二次NPT后得到了图二，为什么有这么大的差距呢？怎么才能得到更为准确的均方位移曲线呢？NPT各个参数均是一样的。

均方位移曲线问题
图一


均方位移曲线问题-1
图二
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2022-08-02 19:16:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵山在汝心

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 灵山在汝心 at 2022-08-05 11:55:43
您好，我了解到可能是没有设置周期性边界条件的原因，想请教一下前辈MS中无定形晶胞怎么设置周期性边界条件的？
...

不好意思，搞错了，好像默认就是周期性的，但我问了一下师兄，他说可能是:模型没有调整成分子链完整，导致分子链越过边界后会有跳跃的情况，请问这种能否在MS中设置？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2022-08-05 12:21:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

灵山在汝心

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-08-03 08:58:23
NVT

我看到有人说NVT更好一点，但是我这个是按照一个文献做的算例，他用的NPT，就是想请教一下完成这个的原因是什么？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2022-08-03 10:23:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天天进步啊

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 灵山在汝心 at 2022-08-03 10:23:48
我看到有人说NVT更好一点，但是我这个是按照一个文献做的算例，他用的NPT，就是想请教一下完成这个的原因是什么？
...

算气体的MSD，才用NPT
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

灵山在汝心
分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
4楼2022-08-03 11:03:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灵山在汝心

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-08-03 11:03:24
算气体的MSD，才用NPT...

我的就是气体啊，氢气

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2022-08-03 12:21:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 288求调剂 +9 王晓阳- 2026-03-09 14/700 2026-03-10 10:07 by S240
[考研] 化工284求调剂 +12 小黑想变白 2026-03-07 12/600 2026-03-10 09:17 by Wahxp
[考研] 新疆大学地质与矿业工程学院招生 +24 another12 2026-03-04 32/1600 2026-03-10 01:15 by 1111--
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
[考研] 一志愿南大化学339分求调剂，四六级已过，有比赛，有文章 +7 Gallantzhou 2026-03-07 7/350 2026-03-09 18:38 by 30660438
[考研] 086000生物与医药319分求调剂 +4 Tolkien 2026-03-07 4/200 2026-03-09 13:49 by macy2011
[考研] 材料调剂 +4 xxxcm 2026-03-08 7/350 2026-03-09 10:11 by EBSD
[考研] 求0856调剂 +5 小力气珂珂 2026-03-08 5/250 2026-03-09 06:42 by houyaoxu
[考博] 26年博士申请 +4 科研狗111 2026-03-07 4/200 2026-03-08 21:56 by 0611517sll
[考研] 070300化学求调剂292分 +3 打烊eee 2026-03-07 3/150 2026-03-07 20:04 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +4 呼呼？~+123456 2026-03-05 5/250 2026-03-06 23:15 by L135790
[考研] 一志愿中石油，化学工程，301求调剂 +4 豚馒枳枳 2026-03-04 4/200 2026-03-06 22:15 by 星空星月
[考研] 08工科求调剂 +3 隆LLL 2026-03-06 4/200 2026-03-06 15:26 by 隆LLL
[考研] 求调剂 +5 danyyyy 2026-03-04 5/250 2026-03-06 08:16 by Leeding1356
[考研] 304分材料专硕求调剂 +11 qiuzhigril 2026-03-03 14/700 2026-03-05 09:30 by vfdbghn
[考研] 264求调剂 +8 26调剂 2026-03-03 8/400 2026-03-04 20:50 by 一切OK
[考研] 0703化学 一志愿东北大学 279分求调剂 +4 聂乐平 2026-03-03 4/200 2026-03-04 16:31 by zhukairuo
[考研] 0703化学求调剂 +3 将未有期 2026-03-04 3/150 2026-03-04 16:19 by sslc1985
[考研] 295求调剂 +4 小赛不吃香菜 2026-03-04 4/200 2026-03-04 16:13 by sslc1985
[考研] 武理材料工程302调剂 +3 Doleres 2026-03-03 6/300 2026-03-04 15:54 by zhukairuo
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭