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lorice

金虫 (正式写手)

[交流] 晶体有a类错误怎么也改不出来,求助!

这是个双核Mn的晶体结构
晶体质量本身就很差,好不容易看到衍射点

现在这个cif 一方面是R1值太大(0.079),另一方面有A类错误,以我们的能力,改不出来

现在想问问呀,这样的晶体会不会成为被拒的理由啊,我怎么办啊

如果能有高手帮忙修改A类错误,我将另赠金币。

先谢谢了!
http://d.namipan.com/d/2b7c03a8f21fda30084a7c6cf4352b9b6d04891d545c0000
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
lorice(金币+5,VIP+0):多谢你的回复,不好意思,我对晶体解析不熟悉,squeeze怎么做啊,如果你能抽空帮我做好,我把剩下的5个金币都双手奉上。 9-11 10:53
eeqeeq0002(金币+1,VIP+0):谢谢参与 9-11 22:01
Click on the hyperlinks for more details of the test.
--------------------------------------------------------------------------------Alert level A
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ueq(max)/Ueq(min) ...       6.02 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.97 Ratio
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C23     
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     238.00 A**3
前三个错误如果不是投ACTA之类的不用处理
后面一个squeeze一下就可以了
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
2楼2009-09-11 10:49:29
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lorice

金虫 (正式写手)

刚刚你回复我说,需要用到ns文件
可是我仔细查看了手上的文件,没看到ns文件啊
3楼2009-09-11 13:24:50
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2009-9-11 10:49:
Click on the hyperlinks for more details of the test.
--------------------------------------------------------------------------------Alert level A
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    C     Ue ...

过来跟帖学习 squeeze咋用云飞兄
4楼2009-09-11 14:56:05
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
lorice(金币+5,VIP+0): 9-13 18:21
引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2009-9-11 14:56:

过来跟帖学习 squeeze咋用云飞兄

platon中的一个命令,点一下产生sqf文件,吧产生的信息拷贝到cif中即可

lz:是ins文件
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
5楼2009-09-11 15:32:07
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2009-9-11 15:32:

platon中的一个命令,点一下产生sqf文件,吧产生的信息拷贝到cif中即可

lz:是ins文件

学习学习 呵呵~~
6楼2009-09-11 15:50:42
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lorice

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2009-9-11 15:32:

platon中的一个命令,点一下产生sqf文件,吧产生的信息拷贝到cif中即可

lz:是ins文件

我真的是外行,确认一下,

是不是用用platon把ins文件打开,点sqeeze命令,产生sqf文件,用记事本把sqf文件打开,将其中文字copy到cif文件的末尾?

谢谢!
7楼2009-09-13 18:22:55
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-13 20:23
是把其中的一部分考进去
不是全部
例如产生的sqf是这样的:# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
   1  0.000  0.000 -0.010       845        57 ' '
   2  0.000  0.500 -0.048        22         1 ' '
   3  0.500  0.000  0.285        22         1 ' '
   4  0.500  0.500  0.618        21         1 ' '
_platon_squeeze_details
;
;


在cif中这行后面:
_refine_ls_shift/su_mean          0.000

考入:
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
   1  0.000  0.000 -0.010       845        57 ' '
   2  0.000  0.500 -0.048        22         1 ' '
   3  0.500  0.000  0.285        22         1 ' '
   4  0.500  0.500  0.618        21         1 ' '
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
8楼2009-09-13 19:14:55
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lorice

金虫 (正式写手)

真不好意思,琢磨了几天,都没把platon软件正常装上,所以,只好求助,能不能请您再帮帮忙?不甚感激啊!

把ins文件列入附件。

http://d.namipan.com/d/5026f69cc ... 531c2fc18e61d270000
9楼2009-09-17 13:55:17
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