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名字太长了

新虫 (小有名气)

[求助] 计算均方位移数据问题

计算出来的均方位移数据纵坐标差别很大,文献是500ps对应40,我的达到了惊人的一千二,
用的forcite模块,电荷不同,吸附量是一样的,都是100m/u,力场一样,set的设置我检查了没有错,所以会是哪里出了问题,
希望可以帮忙解答一下,非常感谢

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天天进步啊

木虫 (著名写手)

1、你需要算扩散系数,不用管这些,看 https://zhuanlan.zhihu.com/p/511125224

2、MSD具体数值跟初始结构有关,你至少需要做3组,求平均
分子筛、分子动力学模拟,有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
2楼2022-07-06 18:59:50
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名字太长了

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-07-06 18:59:50
1、你需要算扩散系数,不用管这些,看 https://zhuanlan.zhihu.com/p/511125224

2、MSD具体数值跟初始结构有关,你至少需要做3组,求平均

好的我去再算算,谢谢

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3楼2022-07-08 20:09:01
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名字太长了

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-07-06 18:59:50
1、你需要算扩散系数,不用管这些,看 https://zhuanlan.zhihu.com/p/511125224

2、MSD具体数值跟初始结构有关,你至少需要做3组,求平均

抱歉还有点问题,就是在forcite分析里边有直接算MSD的,我的结论是直接用的这个模块,它和per脚本出来的msd有差别嘛,如果您看到的话希望可以解答一下,感谢
计算均方位移数据问题



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4楼2022-07-08 20:14:41
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天天进步啊

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 名字太长了 at 2022-07-08 20:14:41
抱歉还有点问题,就是在forcite分析里边有直接算MSD的,我的结论是直接用的这个模块,它和per脚本出来的msd有差别嘛,如果您看到的话希望可以解答一下,感谢

...

没差别

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

分子筛、分子动力学模拟,有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
5楼2022-07-08 20:47:41
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名字太长了

新虫 (小有名气)

送红花一朵
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5楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-07-08 20:47:41
没差别...

好的谢谢解答

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6楼2022-07-09 16:17:47
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