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liujie5631

木虫 (小有名气)

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[交流] 【MS求助成功】【求助】Au(111)表面

请问，我切出了Au(111)表面，但是想在表面上放一个H，可是，发现底物的原子结构变了，第三层的原子没了，跑到了最上面，请问这是怎么回事，怎么解决，非常感谢

[ Last edited by zdhlover on 2009-9-10 at 21:21 ]

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1楼 2009-09-10 13:48:06

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lfhuang

木虫 (著名写手)

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★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢交流 9-10 21:19

（1）楼主所说的Au substrate的原子结构变了，是否是结构优化之后的结果？
（2）是否您的Au substrate只有三层？第三层是最底层？
（3）如果上面两点成立，那么应该是显示问题。比如您的超原胞垂直方向大小为10，范围为0--10，您第三层初始坐标为0.00，优化后，第三层由于表面系统的扩张而向下移动比如0.01，那么此第三层坐标为-0.01，故不显示在此超单胞内（范围0--10），而显示的却是上面一个近邻的周期单胞弟三层，其坐标是10+（-0.01）=0.99，因此显示在上面。