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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【MS求助成功 】【求助】Au(111)表面
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liujie5631

木虫 (小有名气)

[交流] 【MS求助成功 】【求助】Au(111)表面

请问，我切出了Au(111)表面，但是想在表面上放一个H，可是，发现底物的原子结构变了，第三层的原子没了，跑到了最上面，请问这是怎么回事，怎么解决，非常感谢

[ Last edited by zdhlover on 2009-9-10 at 21:21 ]
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1楼 2009-09-10 13:48:06
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hgye

金虫 (小有名气)
★ ★
liujie5631(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):xiexie o(∩_∩)o... 9-10 23:45
没有看明白，是slab底层原子显示到cell另一端吗？
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2楼2009-09-10 14:48:27
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
★ ★
liujie5631(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):xiexie o(∩_∩)o... 9-10 23:45
这个应该是显示问题，对计算没什么影响
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相逢是缘！
3楼2009-09-10 14:49:59
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★ ★
liujie5631(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):xiexie o(∩_∩)o... 9-10 23:45
是不是跟显示模式有关哦 ，改改default, original, incell分别试试看？
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4楼2009-09-10 17:14:17
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B.C.Wang

金虫 (小有名气)
★ ★
liujie5631(金币+1):谢谢参与
wuchenwf(金币+1,VIP+0):xiexie o(∩_∩)o... 9-10 23:45
build crystal 了么？
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5楼2009-09-10 22:48:26
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liusanbing

铜虫 (正式写手)
★
liujie5631(金币+1):谢谢参与
这是显示问题,建的周期平板模型，对计算没有影响
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6楼2009-09-11 08:05:26
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wenxuan5788

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
可能是显示的问题，楼主最好能贴出图片，根据你说的也不太好判断
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7楼2009-09-11 08:06:26
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chen9110

铜虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是不是2D的变成3D的了？
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8楼2009-09-11 08:28:06
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lfhuang

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢交流 9-10 21:19
（1）楼主所说的Au substrate的原子结构变了，是否是结构优化之后的结果？
（2）是否您的Au substrate只有三层？第三层是最底层？
（3）如果上面两点成立，那么应该是显示问题。比如您的超原胞垂直方向大小为10，范围为0--10， 您第三层初始坐标为0.00，优化后，第三层由于表面系统的扩张而向下移动比如0.01，那么此第三层坐标为-0.01，故不显示在此超单胞内（范围0--10），而显示的却是上面一个近邻的周期单胞弟三层，其坐标是10+（-0.01）=0.99，因此显示在上面。
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先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
9楼2009-09-11 08:33:35
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liujie5631

木虫 (小有名气)
非常感谢，确实是显示问题，问题已经解决了，谢谢大家
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10楼2009-09-11 09:29:57
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