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hjsjs

铜虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
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注册: 2008-03-22
性别: GG
专业: 化学环境污染与健康

[交流] 【求助】gaussian ONIOM 求助

Hi everyone,

I am trying to run an ONIOM calculation with B3LYP/6-31+G(d,p) as a high layer
and Amber as my low layer.  The error at the end of the file says I am missing
atomic parameters (see below for the last part of the calc file).  What are
these atomic parameters and where would I obtain them to get my calculation to
work?

Thanking You in Advance,
Sarah Whittleton
Mount Allison University

Th calcaultion dies almost immediatley and ends with:

I=  105 IAn= 15 Valence= 4.
      JB=  1 J=  106 IAn=  8 IBT= 1 Dist= 1.80D+00
      JB=  2 J=  107 IAn=  8 IBT= 2 Dist= 1.48D+00
      JB=  3 J=  171 IAn=  8 IBT= 1 Dist= 1.80D+00
      JB=  4 J=  104 IAn=  8 IBT= 2 Dist= 1.58D+00
Missing atomic parameters for atom 207 IAtTyp= 20000000
Missing atomic parameters.
Error termination via Lnk1e in /var/local/g03/l101.exe at Fri Nov  7 15:18:04
2003.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    7 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1
Scr=    1

我的问题与这个人的相同，这个人在某个论坛上发的求助贴，但是，没有人回应，我又碰到相同的问题了  哎， gjf文件是gaussview产生的，应该不会有问题吧，不知道问题出在哪里？

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1楼2009-09-10 00:57:06

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

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专业: 原子和分子物理

★ ★ ★ ★ ★ ★
loovfnd(金币+2,VIP+0):感谢答案！ 9-10 20:40
hjsjs(金币+4,VIP+0): 9-11 23:26

Gview产生的也会有问题的。
你好好看看你这个原子，根据AMBER手册，把它的参数手动写到.gjf文件里边去就得了。

记住AMBER力场的参数在Gaussian里边是不全的。通常要自己加。
增加的方法有三种，以自己给的参数优先、默认参数优先、只读gjf文件里的参数
。方法在Gaussian手册里。