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天不负者

新虫 (小有名气)


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各位老师们好,我刚开始接触分子模拟,也没有前辈带,最近想重复一篇外文文献的对接结果,好几天没重复成功。文献参数run10次,generation number固定27000,分别改成evalution为short,medium,long,算法分别采用了GA和LGA。按着他的设定差别有点大,我改成了run50次,LGA的时候才能跟文献上GA的结合能差不多,过程中没有报错。所以想问问大家,是我的问题吗?如果蛋白质中有金属离子需要手动分配电荷吗?如果不是我的问题,一般run设置多大呢,generation number一般设置多大呢?

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新虫 (初入文坛)



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引用回帖:
16楼: Originally posted by 巴拉巴拉莎 at 2022-06-27 10:35:40
您好,请问您的分析对接跑出来了吗?我用autodock分析的时候,显示0处对接上,报错indexError:list index out of range是什么原因呀?

我也是这个问题。请问你解决了吗?

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17楼2022-11-27 13:28:09
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gordon3995楼
2022-06-03 23:23   回复  
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tzynew4楼
2022-06-03 23:21   回复  
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孟庆时2楼
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lyns121812楼
2022-06-04 00:11   回复  
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136072274013楼
2022-06-04 00:19   回复  
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Serial10楼
2022-06-03 23:58   回复  
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