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cingym

木虫 (小有名气)

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[交流] 请教envi 后数据的含义？

请教解晶体过程中一个命令envi 后面的数据的含义
例如：
envi c33
c41  1555  1.354
c43  1555  1.328  107.9
q12  1555  0.558  117.7 54.5
q15  1555  0.795  121.7  130.0  102.4

第一列是和C33相连的原子，第二列示对称操作，第三列是该原子与C33的键长，

第四列，第五列，第六列是什么意思？请求高手指点！

另外加水上的H时，除了根据键长数据之外，还有没有别的参考，因为有时与o原子相连的几个Q峰的键长都在0.8左右，不知如何取舍？

谢谢！

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宝剑锋从磨砺出，梅花香自苦寒来！

1楼 2009-09-05 23:42:22

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greenbest

铁杆木虫 (著名写手)

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引用回帖:

Originally posted by yinpanchao at 2009-9-6 00:06:
四五六列对应三个原子的组成的键角。
给水加氢一般可以看周围的Q峰。一般情况在应选取隔O原子在一定范围内的电子密度较大的Q峰。另外这些水分子会跟其他片段形成氢键，可以根据受体原子的位置选取Q峰作为氢原子。 ...

问下楼上三个原子指的是哪三个原子？