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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】弱弱地问：MD仿真的具体尺度大概是多少？
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wdwangcn

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】弱弱地问：MD仿真的具体尺度大概是多少？

采用普通工作站，按照当前的技术水平，MD仿真纳米结构的尺度能否到1000-5000nm？

另：能否推荐一款免费的MD软件啊！
谢了先！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 19:39 ]
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1楼 2009-09-04 09:31:50
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 10:21
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:37
这是介观尺度的模拟，MD 做不了这么大
可以试试 langvein 动力学或 DPD
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2楼2009-09-04 09:39:24
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 10:22
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:37
100个纳米都困难 算算那是多少原子
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3楼2009-09-04 09:51:33
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wdwangcn

金虫 (著名写手)
★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:38
引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2009-9-4 09:51:
100个纳米都困难 算算那是多少原子

但是我是对单层或双层石墨的动力学进行研究，应该用什么方法比较好？
尺度大约在1um-5um左右。
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4楼2009-09-04 10:24:09
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wdwangcn

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2009-9-4 09:39:
这是介观尺度的模拟，MD 做不了这么大
可以试试 langvein 动力学或 DPD

请问哪里有下载，多谢！！
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5楼2009-09-04 10:26:02
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 11:49
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:38
制约 MD的是原子数，如果单层或稀薄气体，可能超大尺度也能处理
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6楼2009-09-04 10:29:53
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 21:15
模拟是什么意思？
实验样品有几个微米你就模拟几个微米？
那要是有几米呢
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7楼2009-09-04 10:46:00
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wdwangcn

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2009-9-4 10:46:
模拟是什么意思？
实验样品有几个微米你就模拟几个微米？
那要是有几米呢

器件本身是几个微米。。
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8楼2009-09-04 11:52:47
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★ ★ ★
wdwangcn(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+3):谢谢 2010-04-03 09:35
引用回帖:
Originally posted by wdwangcn at 2009-9-4 11:52:
器件本身是几个微米。。

lei0736版主的意思是：凡是理论模拟，如果体系太大，就要对体系做合理的简化。器件本身是几个微米，你自己算算吧，那可是成千上万的原子。
理论计算的计算量，一般来说，随着体系的增大，计算量呈几何级数暴涨。如果你拥有IBM超算中心那样的计算资源，俺们没话说。如果你的计算资源并不超级，那还是要进行合理的简化
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9楼2009-09-04 13:41:07
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wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
wdwangcn(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):感谢您的真知灼见，管理层讨论决定，授予您2010年诺贝尔化学奖 9-4 19:44
MD都是周期边界，也就可以说相当于尺度无限大。

石墨层这样的规则结构，有什么必要模拟那么大？

做计算不简化，会死人的
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10楼2009-09-04 14:03:01
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