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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wdwangcn

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】弱弱地问:MD仿真的具体尺度大概是多少?

采用普通工作站,按照当前的技术水平,MD仿真纳米结构的尺度能否到1000-5000nm?

另:能否推荐一款免费的MD软件啊!
谢了先!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 19:39 ]
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 10:21
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:37
这是介观尺度的模拟,MD 做不了这么大
可以试试 langvein 动力学或 DPD
2楼2009-09-04 09:39:24
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 10:22
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:37
100个纳米都困难 算算那是多少原子
3楼2009-09-04 09:51:33
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wdwangcn

金虫 (著名写手)


yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:38
引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2009-9-4 09:51:
100个纳米都困难 算算那是多少原子

但是我是对单层或双层石墨的动力学进行研究,应该用什么方法比较好?
尺度大约在1um-5um左右。
4楼2009-09-04 10:24:09
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wdwangcn

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2009-9-4 09:39:
这是介观尺度的模拟,MD 做不了这么大
可以试试 langvein 动力学或 DPD

请问哪里有下载,多谢!!
5楼2009-09-04 10:26:02
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★
wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 11:49
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-4 13:38
制约 MD的是原子数,如果单层或稀薄气体,可能超大尺度也能处理
6楼2009-09-04 10:29:53
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


wdwangcn(金币+1,VIP+0): 9-4 21:15
模拟是什么意思?
实验样品有几个微米你就模拟几个微米?
那要是有几米呢
7楼2009-09-04 10:46:00
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wdwangcn

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2009-9-4 10:46:
模拟是什么意思?
实验样品有几个微米你就模拟几个微米?
那要是有几米呢

器件本身是几个微米。。
8楼2009-09-04 11:52:47
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★ ★
wdwangcn(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+3):谢谢 2010-04-03 09:35
引用回帖:
Originally posted by wdwangcn at 2009-9-4 11:52:
器件本身是几个微米。。

lei0736版主的意思是:凡是理论模拟,如果体系太大,就要对体系做合理的简化。器件本身是几个微米,你自己算算吧,那可是成千上万的原子。
理论计算的计算量,一般来说,随着体系的增大,计算量呈几何级数暴涨。如果你拥有IBM超算中心那样的计算资源,俺们没话说。如果你的计算资源并不超级,那还是要进行合理的简化
9楼2009-09-04 13:41:07
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wally8962

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
wdwangcn(金币+1):谢谢参与
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):感谢您的真知灼见,管理层讨论决定,授予您2010年诺贝尔化学奖 9-4 19:44
MD都是周期边界,也就可以说相当于尺度无限大。

石墨层这样的规则结构,有什么必要模拟那么大?

做计算不简化,会死人的
10楼2009-09-04 14:03:01
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