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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[求助] 蛋白尺寸,以这种格式*nm×*nm×*nm

各位大佬,请问如何获得可靠的蛋白尺寸,以这种格式*nm×*nm×*nm
比如文献里表述:
Only one molecule of GOx (6.0 × 5.2 × 7.7 nm) can fit in the largest cage (6.2 nm) of PCN-888, while HRP (4.0 ×4.4×6.8 nm) can be accommodated in both the medium (5.0 nm) and large cages.
在PDB数据库得到的GOx的信息(1gpe)里好像没有这样的盒子信息,有一个UNIT cell坐标,
a = 57.6        α = 90
b = 132.1        β = 90
c = 151.3  γ = 90,但是和这个尺寸不匹配呀

请问可以用什么软件做这个尺寸,因为要比较精确,目前实难室有DS软件,也有PYMOL,请大佬赐教!!
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

得到大佬指导了,PYMOL可以做,也足够精确了
2楼2022-03-18 15:45:08
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