| 查看: 401 | 回复: 1 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
吴桂叶金虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】autodock对接结果分析
|
||
|
想请问大家一下，我做autodock对接完成之后，怎样用adt来分析其小分子与大分子的相互作用呢？ 尤其是我从anaylize中的conformation中保存了一种构象的pdb和pdbqt格式。我当时点的是保存 complex对吧？但是保存下载的pdb和pdbqt格式的东西，我在adt里面再重新打开的话，大分子的形态就调整不好了。如果选成大分子是按照表面形态保存，小分子是显示化学键形态的话。那么大分子在小分子插入的部分就变成空的了？这是怎么回事呢？怎么不相文献上所说的应该是小分子在大分子的一沟槽中的感觉呢？ 两个分子相互作用时有静电相互作用，可以用软件给显示出来了 相互作用的危重，而且还标注了重要残基的名称 ，这些我不太清楚AUTO能不能做到？还是需要特殊的软件来分析呢？ 可能说的比较繁琐，谢谢大家的指点了。 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:49 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
退学或坚持读
已经有27人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有5人回复
-
有70后还继续奋斗在职场上的吗？
已经有5人回复
-
遇见不省心的家人很难过
已经有22人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有5人回复
-
多组分精馏求助
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
吴桂叶
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1121.4
- 散金: 123
- 红花: 1
- 帖子: 447
- 在线: 95小时
- 虫号: 452643
- 注册: 2007-11-05
- 性别: MM
- 专业: 有机合成
2楼2009-09-11 17:35:47