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zhangdh_03

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教:苯乙烯分子大约多大?谢谢!

请教:苯乙烯分子和环氧苯乙烯分子各大约多大?
可以在什么软件上根据他的最优构型计算出来吗?
有哪位高手对这个分子熟悉麻烦告诉下。谢谢了!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:36 ]
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhangdh_03(金币+1):谢谢参与
zhangdh_03(金币+4,VIP+0): 9-1 14:08
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 12-16 14:06
小木虫晶体版http://muchong.com/bbs/forumdisplay.php?fid=262

分子的结构尺寸问题,晶体比计算要好。
用ccdc查出来的晶体文件如下
这两个晶体的来源:ActaE,2001,Vol 37,Page:ZZZTKA01是o1189,ZZZTKA02是o1191
==cif文件开始==

data_CSD_CIF_ZZZTKA01
_audit_creation_date 2002-03-27
_audit_creation_method CSD-ConQuest-V1
_database_code_CSD ZZZTKA01
_chemical_formula_sum 'C8 H8'
_symmetry_cell_setting orthorhombic
_symmetry_space_group_name_H-M 'P b c n'
_symmetry_Int_Tables_number 60
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
1 x,y,z
2 1/2+x,1/2+y,1/2-z
3 1/2-x,1/2+y,z
4 x,-y,1/2+z
5 -x,-y,-z
6 -1/2-x,-1/2-y,-1/2+z
7 -1/2+x,-1/2-y,-z
8 -x,y,-1/2-z
_cell_length_a 15.6757(12)
_cell_length_b 10.4805(8)
_cell_length_c 7.5277(6)
_cell_angle_alpha 90
_cell_angle_beta 90
_cell_angle_gamma 90
_cell_formula_units_Z 8
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_radius_bond
C 0.68
H 0.23
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
C1 C 0.26525(6) 0.14911(9) 0.43547(12)
C2 C 0.29626(7) 0.05101(10) 0.54433(13)
H1 H 0.2578(8) -0.0165(13) 0.5869(16)
C3 C 0.38153(7) 0.04777(10) 0.59374(13)
H2 H 0.4012(8) -0.0209(13) 0.6708(18)
C4 C 0.43785(7) 0.14117(10) 0.53422(13)
H3 H 0.5000(9) 0.1371(12) 0.5685(17)
C5 C 0.40803(7) 0.23798(10) 0.42473(13)
H4 H 0.4473(8) 0.3053(13) 0.3816(17)
C6 C 0.32249(7) 0.24176(10) 0.37636(13)
H5 H 0.3008(8) 0.3108(12) 0.2991(17)
C7 C 0.17514(6) 0.15764(11) 0.38098(13)
H6 H 0.1623(8) 0.2238(13) 0.2928(19)
C8 C 0.11121(7) 0.08637(11) 0.43922(15)
H7 H 0.1176(9) 0.0218(15) 0.530(2)
H8 H 0.0527(10) 0.1014(13) 0.3947(19)

data_CSD_CIF_ZZZTKA02
_audit_creation_date 2002-03-27
_audit_creation_method CSD-ConQuest-V1
_database_code_CSD ZZZTKA02
_chemical_formula_sum 'C8 H8'
_symmetry_cell_setting orthorhombic
_symmetry_space_group_name_H-M 'P b c n'
_symmetry_Int_Tables_number 60
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
1 x,y,z
2 1/2+x,1/2+y,1/2-z
3 1/2-x,1/2+y,z
4 x,-y,1/2+z
5 -x,-y,-z
6 -1/2-x,-1/2-y,-1/2+z
7 -1/2+x,-1/2-y,-z
8 -x,y,-1/2-z
_cell_length_a 15.6898(6)
_cell_length_b 10.5854(4)
_cell_length_c 7.5745(2)
_cell_angle_alpha 90
_cell_angle_beta 90
_cell_angle_gamma 90
_cell_formula_units_Z 8
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_radius_bond
C 0.68
H 0.23
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
C1 C 0.73539(6) 0.14843(9) -0.06363(12)
C2 C 0.67816(7) 0.24001(10) -0.12281(13)
H1 H 0.6993(7) 0.3088(10) -0.1979(15)
C3 C 0.59281(7) 0.23632(10) -0.07546(14)
H2 H 0.5524(8) 0.3035(11) -0.1194(15)
C4 C 0.56301(7) 0.14089(10) 0.03352(13)
H3 H 0.5009(9) 0.137(1) 0.0649(15)
C5 C 0.61904(7) 0.04872(10) 0.09343(13)
H4 H 0.5988(7) -0.0204(11) 0.1713(17)
C6 C 0.70412(7) 0.05179(9) 0.04508(13)
H5 H 0.7441(7) -0.0152(12) 0.0879(14)
C7 C 0.82548(7) 0.15667(10) -0.11697(14)
H6 H 0.8381(7) 0.2230(12) -0.2019(18)
C8 C 0.88888(8) 0.08554(12) -0.06109(17)
H7 H 0.8807(9) 0.0176(15) 0.0296(19)
H8 H 0.9479(9) 0.0991(12) -0.1040(17)

==cif文件结束==


[ Last edited by yjcmwgk on 2009-9-1 at 13:32 ]
2楼2009-09-01 13:27:31
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zhangdh_03

铜虫 (正式写手)

谢谢楼上的回复。

您给出的_cell_length_a 15.6898(6)
_cell_length_b 10.5854(4)
_cell_length_c 7.5745(2)中长度单位是什么呢:  是"埃"吗?
3楼2009-09-01 14:08:05
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浮云。。。

至尊木虫 (文坛精英)


zhangdh_03(金币+1):谢谢参与
学习了!
4楼2009-09-01 14:42:42
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2008911

银虫 (小有名气)

★ ★
zhangdh_03(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 12-21 10:06
你可以用MS进行优化计算
超光速
5楼2009-09-02 09:43:52
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tang2711

铜虫 (小有名气)

★ ★
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):禁止抄袭楼上的 10-21 19:01
MS进行优化计算
6楼2009-10-21 18:37:59
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):QHULL? 12-16 14:06
有国外的教授用MC编写过计算分子体积的软件,具体是哪位忘了。。。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
7楼2009-12-14 22:39:09
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 12-21 10:06
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2009-12-14 22:39:
有国外的教授用MC编写过计算分子体积的软件,具体是哪位忘了。。。

版主,找到那个软件了,在附件里。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
8楼2009-12-17 20:02:18
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