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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】安装gromacs可否不用LAM而用MPICH
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liuyalihd

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】安装gromacs可否不用LAM而用MPICH

我的集群环境是MPICH1.5.2,我要安装gromacs！我看gromacs网站上提供了LAM。
因为我已经有了mpich,就不想安装LAM了！直接用mpich并行可以吗？

关键问题是如何安装gromacs时，指出使用我的mpich呢？
在configure里如何配？

谢谢各位！

[ Last edited by wuli8 on 2009-11-13 at 21:40 ]
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1楼 2009-09-01 09:50:07
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yjqqliu

银虫 (初入文坛)
★
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 9-1 17:47
mpich可以呀
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2楼2009-09-01 16:26:43
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antediluvian

金虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 9-1 19:35
在编译并行版本时，指定mpich所对应的编译器而不是lam的就可以，当然我建议你编译前预先屏蔽lam的相关设置
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3楼2009-09-01 18:26:33
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liuyalihd

铜虫 (小有名气)
请问两位:

因为在configure gromacs时, 没有明确指出 mpi 路径

但是系统的path中已经有我mpich1.5.2的目录,还有lam(我也安装了)的目录

导致了make,make install时, gromacs会选择那个mpi呢?是选择path中排在前面的mpi 吗?

为了避免冲突,我是不是不要安装lam, 直接用我的mpich就可以呢!
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4楼2009-09-01 20:15:58
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