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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】MS计算主链带环聚合物的问题
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z_w_zhang

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】MS计算主链带环聚合物的问题

各位大侠：
我构建了主链带苯环的聚合物，因为构建过程中苯环的部分原子不能被选择上，导致这部分原子不能被有效的力场（Discover中的Minizer）优化，导致Amorphous Cell中Constructure不能进行。
直接导入主链带苯环的聚合物，该计算也不能进行。
请问：如何解决上述问题？

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-13 at 02:58 ]
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1楼 2009-08-31 08:43:12
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cassie0795

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
为什么构建时不选全部的原子呢？有一部分原子没有设置力场肯定就优化不了
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2楼2009-09-01 08:33:28
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z_w_zhang

新虫 (初入文坛)
问题解决了，我用复制-黏贴的方法构建高分子就不存在选择主链的问题，这样全部原子都可以被优化。
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3楼2009-09-01 08:43:28
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