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lijianghua2007荣誉版主 (职业作家)
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求助Alert level B中的 Hirshfeld Test 检查问题
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Alert level B Hirshfeld Test Diff (M-X) Ag2 -- S1 .. 32.44 su 我试过了下面两命令： delu 0.02 Ag2 S1 simu 0.02 Ag2 S1 或 delu 0.005 Ag2 S1 simu 0.005 Ag2 S1 等等，都没消除这个B类错误！ |
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2楼2009-08-30 10:42:17
lijianghua2007
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6楼2009-08-30 10:55:08
marise
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lijianghua2007(金币+1,VIP+0):谢谢你，我先就这么办，看看还有其他的办法不？ 8-30 11:00
lijianghua2007(金币+1,VIP+0):谢谢你，我先就这么办，看看还有其他的办法不？ 8-30 11:00
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下面是“xi2004老师"给我问题的参考意见： 这个alert (PLAT 232 ), 意思是说成键的两个原子, 在键的方向上的各向异性热参数Uij应该基本相同. 可是在你的结构中 Cu-Cl1i ( i =1-x, 1-y, 1-z) is 2.777埃,并不成键,所以Cu1 -- Cl1_a .. 24.36 su 也是正常的. 所以我认为这个alert可以不理. 你不投acta, 就这样好了. PLAT232 -------------------------------------------------------------------------------- PLAT232 Type_2 Hirshfeld Rigid-Bond Test (Metal-X) (Acta Cryst (1976),A32,239-244 -------------------------------------------------------------------------------- The components of the anisotropic displacement parameters along chemical bonds are assumed to be equal in magnitude. Large differences supposedly indicate contamination of these parameters with other (unresolved) effects such as (substitutional) disorder, model or data errors and/or over-refinement. Atomic sites assigned the wrong scattering type (e.g. Ag versus Br) should generate 'problem signals' with this test. Data sets corrected for absorption effects with DELREF techniques (e.g. DIFABS, SHELXA, XABS2) often show large DELU values for bonds involving the heaviest atom. A special case are M-C=O type of systems that generally show significant differences for the M-C bond. See D.Braga & T.F. Koetzle (1988), Acta Cryst. B44, 151-155). Note: The original 'Hirshfeld-test' was defined in absolute terms (see F.L.Hirshfeld, Acta Cryst. (1976). A32, 239-244). The current test is with reference to the associated standard uncertainty. [ Last edited by marise on 2009-8-30 at 11:01 ] |
7楼2009-08-30 10:58:21
8楼2009-08-30 11:57:53
