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木虫 (著名写手)

[交流] 广东省农业科学院水稻研究所生物信息学课题组博士后招聘

具体工作地点:
广东省农科院水稻所
薪金:
≥33万

广东省农业科学院水稻研究所生物信息学课题组博士后招聘

广东省农业科学院水稻研究所拥有悠久的历史,是国家水稻改良分中心。科研条件优秀,建有广东省水稻育种新技术重点实验室、国家种质广州野生稻圃、广东省水稻种质资源库、省级现代农业(水稻)产业技术研发中心、国家引进国外智力成果示范推广基地、广东省水稻科技创新中心等平台。主要开展以水稻育种研究为中心的稻作科技创新,在从事水稻新品种(组合)选育研究的同时,开展生物信息学、生物技术、稻种资源、耕作栽培、生理生态等相关研究,为水稻育种和生产提供强大的科技支撑。

RNA是基因信息传递的桥梁,受到多种复杂的转录后调控,包括选择性剪切、RNA修饰、小RNA调控和翻译调控等,一直以来都是科学研究的热点领域。很多疾病和动植物表型是由转录后调控元件的异常突变引起。然而,由于高效生物信息学算法和软件缺乏,基于生物信息学的RNA调控研究受到严重制约。针对这一重要问题,课题组负责人前期研究建立了多种RNA生物信息学算法、软件和数据库,已开发出首款RNA修饰鉴定与注释的软件RNAmod、基于Ribo-Seq的RNA翻译综合分析软件RiboToolkit,小RNA鉴定、定量以及修饰鉴定软件sRNAtools、选择性剪切鉴定、注释和可视化综合软件SplicingViewer、基于外显子组重测序的突变注释软件Exome-assistant、microRNA鉴定与分析软件mirTools2.0、基于贝叶斯算法的甲基化修饰鉴定算法Bscom、甲基化修饰注释软件RRBSanalyzer、新生突变数据库EpiDenovo以及植物24-nt siRNA数据库Pln24NT等,不仅填补和充实了相关生物信息学研究,也为RNA调控研究提供重要的生物信息学支持。课题组还开展比较基因组学与系统生物学研究,构建了杨树功能基因网络PoplarNet以及基于基因网络的杨树功能基因注释平台PoplarGene。与此同时,课题组还研究了RNA表观修饰特别是tRNA修饰的生物学机制研究,以tRNA的m7G修饰为切入点,开发TRAC-seq测序技术揭示m7G修饰能影响特定基因的翻译从而阻碍细胞分化。采用开发的软件、公共大数据、TRAC-seq技术和蛋白组技术研究m7G修饰甲基化转移酶Mettl1基因的分子作用机理,相关研究奠定了其他tRNA修饰的机理和作用解析的重要基础,为开发tRNA水平的分子标记提供了新的思路。
课题组负责人已发表SCI论文36篇,其中通讯和一作SCI论文15篇。作为一作,共同一作或共同通讯在Molecular Cell(2018,2021)、Nucleic Acids Research(2018,2019,2020)、Briefings in Bioinformatics(2019)、EMBO reports(2020)、Bioinformatics(2017)、PLoS Computational Biology(2014)、Human mutation(2013)和Genomics(2012)等期刊上发表文章15篇(TOP期刊9篇),其中6篇IF>10.0、1篇 IF>8.0,2篇>5.0。作为主要生物信息学作者在Nature、Nature Protocol、Nature Communication、Cell Research上发表多篇RNA翻译调控研究相关论文。

目前开展的课题方向为:
1.        开发RNA生物信息学方法、软件和平台开展基于RNA转录后调控(特别是非编码RNA和mRNA翻译、修饰、剪切和编辑)的水稻分子育种相关研究,结合水稻全基因组测序、表型组学、比较基因组学、群体遗传学和分子生物学,研究水稻发育与杂种优势、抗逆、野生稻驯化在RNA水平的分子调控机制,挖掘水稻优势性状的RNA分子标记,使用RNA生物技术为水稻分子育种与改良提供重要信息。

2.        基于系统生物学和功能基因网络,构建大规模的水稻基因网络和调控网络,开发网络算法鉴定品质和抗性性状相关的新候选基因,使用CRISPR等进行大规模地功能验证。
3.  水稻表型组学中的图片模式识别技术和数据库构建。

1、博士后招收条件
具备良好的政治素养和道德修养,无不良记录;
具有相关学科背景,品学兼优,勤奋上进,身体健康;
申请者年龄在35周岁以下;
能够全脱产从事博士后研究工作;
农学、生物学、生物信息学、计算机等专业。
2、工作条件及待遇
博士后在站期间实行岗位绩效工资制度,年收入≥ 33万元,可面议;
提供良好的生活居住条件,可按规定租住院周转房;
博士后子女可入读农科院幼儿园,享受农科院职工子女同等待遇;
提供优秀的博士后训练机会,博士后出站考核优秀者,可优先正式编制留院工作。

联系方式
有意向者请将简历发到:biolq@qq.com

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