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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【讨论】这种3D结构是用何软件模拟的
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fhqbdi

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】这种3D结构是用何软件模拟的

Energy-minimized 3D diagram
有什么软件可以做小分子的能量最小化，或者什么网页可以做小分子的能量最小化
如下图中是用何软件处理的

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:59 ]
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1楼 2009-08-28 19:04:14
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by fhqbdi at 2009-8-29 22:12:
那我想先使能量最小化再做图，用何软件。也就是我上面图中那样，图中化合物都是处在能量最小装态。

首先，俺很崩溃。
第二，建议你找个专做量化的，让ta做第二作者，让ta的导师做第二通讯。你不要管计算的问题了，你只管提要求。这样最简单了。就您这概念的混乱程度，俺们要在论坛上码字儿就能给您讲清楚，那俺们是神人
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13楼2009-09-17 15:05:39
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
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erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 8-28 20:08
好多都可以啊，gaussview等，molden
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莫强求！
2楼2009-08-28 19:45:30
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主的意思是不是没有表达清楚啊?
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3楼2009-08-28 20:09:25
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shenhai1315

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by loovfnd at 2009-8-28 19:45:
好多都可以啊，gaussview等，molden

是呀，好多软件应该都可以模拟出来的。楼主是不是想表达这个图怎么做出来的哦
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4楼2009-08-28 21:51:00
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