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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 如何在让tex中生成的Z值和原子个数是整数?
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louiyang

木虫 (正式写手)

[交流] 如何在让tex中生成的Z值和原子个数是整数?

生成的tex文件中,经常有Z值和原子个数是小数的情况,该怎么弄才好
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1楼 2009-08-28 17:16:06
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beanhui

金虫 (小有名气)
同问
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2楼2009-08-28 17:19:21
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dpzhang

木虫 (正式写手)

nihao

★ ★
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waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-28 19:12
要吧lst中的哟管数值写到Ins中，然后精修。在生成tex
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生活还要继续
3楼2009-08-28 17:34:30
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louiyang

木虫 (正式写手)
这个哟管数是指什么,麻烦说得详细一点
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4楼2009-08-28 21:10:06
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
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paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-29 08:57
Z ????????????,??????п???packing ?к??????????????????б??????????????,?@Щ?????????XXX.ins?˙n?????--->??????


TITL XXXX in Pbca
CELL 0.71073  13.9820  20.3331  22.8019  90.000  90.000  90.000
ZERR  4.00   0.0003   0.0003   0.0006   0.000   0.000   0.000------->4??Z?
LATT  1
SYMM 0.5-X, -Y, 0.5+Z
SYMM -X, 0.5+Y, 0.5-Z
SYMM 0.5+X, 0.5-Y, -Z
SFAC C H O ZN
UNIT 272 344 32 28---------------->??????
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Smart_work_and_beautiful_life!
5楼2009-08-28 21:40:49
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louiyang

木虫 (正式写手)
关键是lst和tex不一致呀,tex中原子个数是小数

[ Last edited by louiyang on 2009-8-28 at 21:56 ]
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6楼2009-08-28 21:52:58
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棉中藏刺

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这是一个关于确定Z值问题！
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7楼2009-08-28 22:48:29
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-29 08:57
1) Z value (number of formula units per cell) followed by the estimated standard deviations in the unit-cell dimensions. Z is only required for the CIF output; the cell esds contribute to the estimated esds in bond lengths etc. after full-matrix refinement.

2) Look at the value that XPREP has calculated for Z (the number of formula units per unit
cell). Z is always an integer and very often is a power of 2 (1, 2, 4, 8, or 16), and more rarely other numbers (e.g. a multiple of 3 for trigonal and hexagonal space groups).

3) Calculate an approximate value of Z using the following formula (which works for many organic and inorganic compounds):

     Z = (volume of unit cell in Å3) / (10 times the number of atoms in molecule)

This formula often gives values of Z that are more reliable than those suggested by XPREP. More sophisticated methods for estimating Z have also been discussed (see Girolami, G. S. J. Chem. Educ. 1994, 71, 962-964).

4) XPREP sometimes miscalculates Z and gives an unreasonable value such as 5; if this is the case, override it by typing Z and then enter in a new value.

上文介绍了如何来确定初步的Z值。在LZ的case里，建议你查看自己的lst文件，找到如下位置：

Unit-cell contents from UNIT instruction and atom list resp.

C        66.00     46.00
H        54.00     54.00
N         4.00      4.00
Co        4.00      4.00
O         4.00      4.00

查看你的ins文件，找到如下位置：
………………
SFAC C H  N  Co  O
UNIT 66 54 4 4 4
………………
修改UNIT的原子个数为上述lst文中第二列相应数字

为

………………
SFAC C H  N  Co  O
UNIT 46 54 4 4 4
………………
接下来就要修改Z值，如果想避免最后的txt文件中出现小数的话，需要找到一个最佳Z值，我通常的做法就是最大公约数。 另外，Z值大都是为2^n （1, 2, 4, 8, or 16）。很少出现异常数值，只有少数在trigonal and hexagonal的space group中有3的幂指数Z值。


Z值的确定大概是如此了。共勉。
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There is a will,there is a way.
8楼2009-08-29 02:42:45
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
8楼总结得很好.
补充一点. Z值的大小取决于
1.空间群的等效点系数目
2. 你自己认为的组成结构的最基本单元(formula).

举个简单的例子

空间群P-1, 等效点数是2, 所以一般Z值就是2.

但是如果你的配合物中有一个金属, 又正好处于特殊位置, 其sof 是0.5, 要经过对称操作后才是个完整的配合物(比如CuL2). 那么, z=1,  formua是CuL2.

换句话说, 如果你取formula为Cu0.5L,那么Z=2; 取 formula =CuL2, 则Z=1


还有, 有时侯你加氢没加完, 则不能全信.lst中所列的, 要把没加的H算到你的分子式中.
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xi2004-emuch@163.com
9楼2009-08-29 10:26:19
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louiyang

木虫 (正式写手)
总结地很精彩,谢谢啦
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10楼2009-08-29 19:26:32
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