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lihaoexe

银虫 (小有名气)

[交流] 如何确定一个转录调控蛋白的顺式作用元件

如果有一个转录调控蛋白,仅知道其序列,市场上也没有它的抗体产品不能做ChIP,应该怎么确定它调控的基因和结合位点呢?
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lihaoexe

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cxl_yll at 2009-12-25 22:54:
你说的具体点吗?我也是做启动子的,我要先找到顺式元件  在找转录因子,谢谢了

我们是实际上已经全基因组测序,制作基因芯片通过生物信息学方法预测比较重要的转录调控因子,通过实验方法验证它的功能,我这是下游的工作了,上游生物信息学才是找顺势元件,这个我也不太懂
10楼2009-12-26 19:47:55
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lihaoexe

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 克隆大虾 at 2009-8-30 11:00:
凝胶阻滞实验

凝胶阻滞不能在全基因组上筛选吧,太长了
3楼2009-08-30 18:35:48
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myhzy2819

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
lihaoexe(金币+3,VIP+0): 8-31 11:44
引用回帖:
Originally posted by lihaoexe at 2009-8-28 16:27:
如果有一个转录调控蛋白,仅知道其序列,市场上也没有它的抗体产品不能做ChIP,应该怎么确定它调控的基因和结合位点呢?

要加标签蛋白就可以了~~~
[url=http://www.91cool.net/][img]http://ip.91cool.net/sign/free.gif[/img][/url]
4楼2009-08-30 20:11:26
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lihaoexe

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by myhzy2819 at 2009-8-30 20:11:

要加标签蛋白就可以了~~~

您是指在体外表达该蛋白并加标签吗?我也想到了这样做,但是不知道能行的通不,有没有相关文献啊?谢谢回复!
5楼2009-08-31 11:47:44
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