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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何确定一个转录调控蛋白的顺式作用元件
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lihaoexe

银虫 (小有名气)

[交流] 如何确定一个转录调控蛋白的顺式作用元件

如果有一个转录调控蛋白，仅知道其序列，市场上也没有它的抗体产品不能做ChIP，应该怎么确定它调控的基因和结合位点呢？
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1楼 2009-08-28 16:27:49
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)
凝胶阻滞实验
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2楼2009-08-30 11:00:57
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lihaoexe

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 克隆大虾 at 2009-8-30 11:00:
凝胶阻滞实验

凝胶阻滞不能在全基因组上筛选吧，太长了
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3楼2009-08-30 18:35:48
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myhzy2819

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
lihaoexe(金币+3,VIP+0): 8-31 11:44
引用回帖:
Originally posted by lihaoexe at 2009-8-28 16:27:
如果有一个转录调控蛋白，仅知道其序列，市场上也没有它的抗体产品不能做ChIP，应该怎么确定它调控的基因和结合位点呢？

要加标签蛋白就可以了~~~
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4楼2009-08-30 20:11:26
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lihaoexe

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by myhzy2819 at 2009-8-30 20:11:

要加标签蛋白就可以了~~~

您是指在体外表达该蛋白并加标签吗？我也想到了这样做，但是不知道能行的通不，有没有相关文献啊？谢谢回复！
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5楼2009-08-31 11:47:44
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myhzy2819

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lihaoexe(金币+7,VIP+0):谢谢回复，如果您能提供相关文献将不胜感激，lihaoexe@yahoo.com.cn 8-31 13:49
是呀，看到有许多文献这么做的~~
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6楼2009-08-31 11:53:14
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cxl_yll

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
问一下楼主 你的转录调控蛋白怎么拿到的？谢谢
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7楼2009-12-25 20:18:46
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lihaoexe

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by cxl_yll at 2009-12-25 20:18:
问一下楼主 你的转录调控蛋白怎么拿到的？谢谢

体外表达
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8楼2009-12-25 22:16:07
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cxl_yll

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你说的具体点吗？我也是做启动子的，我要先找到顺式元件  在找转录因子，谢谢了
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9楼2009-12-25 22:54:51
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lihaoexe

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by cxl_yll at 2009-12-25 22:54:
你说的具体点吗？我也是做启动子的，我要先找到顺式元件  在找转录因子，谢谢了

我们是实际上已经全基因组测序，制作基因芯片通过生物信息学方法预测比较重要的转录调控因子，通过实验方法验证它的功能，我这是下游的工作了，上游生物信息学才是找顺势元件，这个我也不太懂
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10楼2009-12-26 19:47:55
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