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haozhm

铜虫 (小有名气)


[交流] 无序处理问题?

如图中结构是个无序结构,在我处理时,把C1 to C10, and N1 and N2的占有率都变为了0.5,并且在上面限定了其中的院子不成键的。可是checkcif后发现,这套数据还是有些问题
EQIV  $7_x, -y+1/2, z
EQIV $8_x, -y+3/2, z
FREE C1 C1_$8
FREE C1 C2_$8
FREE C2 C2_$8
FREE C2 C1_$8
FREE C2 C3_$8
FREE C4 C4_$7
FREE C5 C5_$8
FREE C7 C7_$7
FREE C4 C8_$7
FREE C4 C6_$7
FREE C8 C7_$7
FREE C8 C8_$7
FREE C9 C9_$8
FREE C9 N2_$8
FREE C9 C10_$8
FREE C10 C10_$8
FREE C10 C9_$8
FREE C10 C6_$8
FREE N2 N2_$8

问题:
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   2.127
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       2.13      
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C1      is NPD .....................          ?     
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C3     --  C3      ..       1.97 Ang.
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C6     --  C7      ..       2.00 Ang.
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C7     --  C8      ..       1.89 Ang.
PLAT773_ALERT_2_A Suspect C-C Bond in CIF:   C7     --  C6      ..       2.00 Ang.
PLAT075_ALERT_1_A Occupancy       2.00 greater than 1.0 for ......         C9      
不太懂呀,需要如何处理,请高手赐教!
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wtt689

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
同样学习,期待高手解决
2楼2009-08-26 17:30:34
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hqzhang

铁杆木虫 (著名写手)

研究僧

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-28 20:08
你这个C-C键太长了,仔细检查一下。
3楼2009-08-26 17:31:35
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haozhm

铜虫 (小有名气)


cif检查错误中,C-C键的可以再增加一些不成键的设定来消除。而对于其它的几个错误,确实不太好解决,比如第一、第二个,数据部收敛,可以通过增加精修的次数消除,但是在这个例子里,即使精修几百圈后,cif检查还是会出现同样的错误。不知,这样的数据,不用处理,是不是可以接受呢?
4楼2009-08-26 17:37:41
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-27 10:07
这种情况, 要看看低对称性行不行. 如果不行, 采用高对称性的, 那么做个解释也是可以的. 但为何C1 NPD呢?

[ Last edited by xi2004 on 2009-8-26 at 22:42 ]
xi2004-emuch@163.com
5楼2009-08-26 20:13:26
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