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关于有参转录组比对率低的问题。求助 已有1人参与
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各位虫友: 您好。现有一关于有参转录组比对率低的问题向大家请教! 本人所进行的试验为自毒物质对植物根系进行胁迫,研究根系边缘细胞(能够遇水自动脱落的细胞)基因表达水平的变化。将样品送公司以后达到了检测合格标准,但数据回来时发现有两个处理的三次重复比对率很低。其中CK和处理2(中浓度)的比对率在86%以上(这个属于正常),而处理1(低浓度)的比对率分别为45%,60%和77%%,处理3(高浓度)的比对率分别为29%,39%和45%。 先想请教 问题一:这是什么原因造成的呢?给公司打电话咨询也没有给出肯定回答,只说有可能是胁迫影响的,但是处理2(中浓度)的比对率在86%以上,如果是胁迫原因造成,处理2的比对率也应该降低才对。 问题二:是否有虫友经历过此种情况呢?在写论文的时候,如何解释该问题? |
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