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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】求助分子模拟的高手解决菜鸟级问题
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zhaoliang_fly

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助分子模拟的高手解决菜鸟级问题

我想问问：
    老板让我学习GROMACS这个软件，可能以后要处理一些蛋白质和DNA这些领域的东西。GROMACS是基于牛顿力学的计算软件，好像不能处理分子中电子的问题，因为我原来本科是学习物理的，很喜欢量子力学，所以想在以后处理这些问题时能在用到量子力学的东西。矛盾就在这里了，研究蛋白质和DNA这方面能不能用侧重量子力学的计算软件来做？如果可以，我需要再学习一些什么课程？学一些什么软件？
    希望这方面的高手给予些意见！

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-15 at 02:36 ]
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Molecular dynamics simulation!
1楼 2009-08-24 16:18:00
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 才情高啊 8-24 21:31
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):佩服老汉 8-24 21:41
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-8-24 20:38:
俺可没这么说！呵呵

独在异乡为异客
相逢未必曾相识
活性位点到处有
只恐配体难称心
赞一下(17人) 回复此楼
6楼2009-08-24 21:15:20
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):感谢老汉 8-24 18:38
看看QM/MM吧。
MM负责外围，QM清理内部。
赞一下(7人) 回复此楼
2楼2009-08-24 16:20:12
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 8-24 21:30
看看QM/MM吧。
MM负责外围结构，QM计算活性位点
赞一下(11人) 回复此楼
3楼2009-08-24 18:45:46
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-8-24 18:45:
活性位点

怎么活性位点都藏在肚子里啮？
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-08-24 19:57:06
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