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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 基因克隆缺失碱基疑问
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pylau1988

新虫 (小有名气)

[交流] 基因克隆缺失碱基疑问

请问各位专家，我根据转录组测序得到一个基因的CDS序列，设计引物扩增该基因的全长CDS，PCR产物经测序后发现，靠近3端的中间部分缺失了39个碱基（缺失后也能正常翻译，就是跟转录组比少了13个氨基酸），请问这是什么原因造成的？是PCR扩增出问题还是克隆到了该基因的剪接突变基因？谢谢大家
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1楼 2021-10-21 13:48:10
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局也土豆

新虫 (小有名气)
★
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
我也有这种情况，出现这种情况应该怎么做呢？继续做还是？

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8楼2021-10-22 18:27:45
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534720018

至尊木虫 (著名写手)
★
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
多测几次看看先

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3楼2021-10-21 15:07:47
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pylau1988

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 534720018 at 2021-10-21 15:07:47
多测几次看看先

随机挑了3个克隆测序都是缺39个碱基，换了公司测也是同样的结果
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4楼2021-10-21 16:24:50
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fuyuandj86

版主 (著名写手)
★
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
剪切拼接异构体

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6楼2021-10-21 17:37:56
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pylau1988

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 局也土豆 at 2021-10-22 18:27:45
我也有这种情况，出现这种情况应该怎么做呢？继续做还是？

可以继续做，这也是基因的一种转录本
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11楼2021-10-25 11:12:05
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tzynew2楼
2021-10-21 14:42   回复  
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
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nono20095楼
2021-10-21 17:16   回复  
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miaojiabing7楼
2021-10-21 22:41   回复  
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6号枫木塔9楼
2021-10-23 19:53   回复  
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bjdxyxy10楼
2021-10-24 20:50   回复  
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范慕博12楼
2022-11-13 15:41   回复  
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