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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 基因克隆缺失碱基疑问
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pylau1988

新虫 (小有名气)

[交流] 基因克隆缺失碱基疑问

请问各位专家，我根据转录组测序得到一个基因的CDS序列，设计引物扩增该基因的全长CDS，PCR产物经测序后发现，靠近3端的中间部分缺失了39个碱基（缺失后也能正常翻译，就是跟转录组比少了13个氨基酸），请问这是什么原因造成的？是PCR扩增出问题还是克隆到了该基因的剪接突变基因？谢谢大家
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1楼2021-10-21 13:48:10
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pylau1988

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 534720018 at 2021-10-21 15:07:47
多测几次看看先

随机挑了3个克隆测序都是缺39个碱基，换了公司测也是同样的结果
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4楼2021-10-21 16:24:50
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pylau1988

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 局也土豆 at 2021-10-22 18:27:45
我也有这种情况，出现这种情况应该怎么做呢？继续做还是？

可以继续做，这也是基因的一种转录本
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11楼2021-10-25 11:12:05
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