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wxstongxue6161

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[交流] 【求助】菌种鉴定

各位大侠，菌种鉴定要经过几个步骤啊？真菌鉴定，有的说是18sRNA的序列分析，有的说要18sDNA的序列分析，是不是这两种方法都行啊？细菌鉴定就是16s18sRNA的序列分析啊？在进行序列分析的时候，是不是还的同时做生理生化实验？这是必须做的一项么？

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给自己一片悬崖,让自己无路可退.

1楼 2009-08-21 22:30:05

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brightfuture01

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看你的最终目的了，要鉴定到多细。一般的是做个16或者18SrRNA的序列比对，大致

把它归结于某个属，大多情况下都可以比对出和某属中的某种同源性最高。这是最为

简便的鉴定了，如果你的序列比对发现真个datebase里面的序列信息和你的菌的相似

性程度比较低，如95％以下，那很有可能就是新种了，这时候就可以做得更加详细，

光做生理生化还不行，还要作脂肪酸啊什么的，这样就可以发不错的文章。要是你的

序列和数据库中现有的序列相似性非常高，如98－99％－100％，那么除非你获得的

菌有某种性质，如产酶很高，可以作下生理生化，否则你就只是为了初步鉴定的话，

个人认为没有必要作生理生化了，没什么意义。

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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.

2楼2009-08-21 22:41:46

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wxstongxue6161

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引用回帖:

Originally posted by brightfuture01 at 2009-8-21 22:41:
看你的最终目的了，要鉴定到多细。一般的是做个16或者18SrRNA的序列比对，大致

把它归结于某个属，大多情况下都可以比对出和某属中的某种同源性最高。这是最为

简便的鉴定了，如果你的序列比对发现真个date ...

细菌的鉴定，用16 SrRNA和 16S rDNA 序列分析这两种方法都是鉴定细菌的方法么，哪个方法最常用？（还有就是用18 SrRNA和 18S rDNA 序列分析这两种方法都是鉴定真菌的方法么，哪个方法最常用？）
谢谢

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给自己一片悬崖,让自己无路可退.

3楼2009-08-21 23:18:56

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