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wxstongxue6161木虫 (正式写手)
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【求助】菌种鉴定
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| 各位大侠,菌种鉴定要经过几个步骤啊?真菌鉴定,有的说是18sRNA的序列分析,有的说要18sDNA的序列分析,是不是这两种方法都行啊?细菌鉴定就是16s18sRNA的序列分析啊?在进行序列分析的时候,是不是还的同时做生理生化实验?这是必须做的一项么? |
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看你的最终目的了,要鉴定到多细。一般的是做个16或者18SrRNA的序列比对,大致 把它归结于某个属,大多情况下都可以比对出和某属中的某种同源性最高。这是最为 简便的鉴定了,如果你的序列比对发现真个datebase里面的序列信息和你的菌的相似 性程度比较低,如95%以下,那很有可能就是新种了,这时候就可以做得更加详细, 光做生理生化还不行,还要作脂肪酸啊什么的,这样就可以发不错的文章。要是你的 序列和数据库中现有的序列相似性非常高,如98-99%-100%,那么除非你获得的 菌有某种性质,如产酶很高,可以作下生理生化,否则你就只是为了初步鉴定的话, 个人认为没有必要作生理生化了,没什么意义。 |

2楼2009-08-21 22:41:46
wxstongxue6161
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4楼2009-08-21 23:24:56
johnsionzhang
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