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有所为4312

新虫 (小有名气)

[交流] CRISPR-CS9能对无参考基因组的丝状真菌基因进行编辑吗?

求助大家,基因编辑小白一个,我们有一株丝状真菌,想问下没有参考基因组,但是我们做了它的全长转录组,那CRISPR-CS9能对无参考基因组的基因进行编辑吗,谢谢各位大佬了

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forhighbio

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有所为4312: 金币+5 2021-09-07 16:23:17
建议可以先做做荧光标记,选一个比较稳定的质粒骨架和抗性筛选标记,然后先选几个基因做RNA干扰,观察下表型。

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2021-09-07 08:42:44
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有所为4312

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by forhighbio at 2021-09-07 08:42:44
建议可以先做做荧光标记,选一个比较稳定的质粒骨架和抗性筛选标记,然后先选几个基因做RNA干扰,观察下表型。

非常感谢您的回答,选择的pSlient-1质粒做RNAi,但是结果不太好,也不知道是选的基因片段没选好。还是载体根本就没在菌株内发挥作用,P了抗性基因,确定质粒肯定进去了,但是对菌株的表型没有影响。所以就想着看能不能把基因敲除掉或者编辑掉,来看看表型,所以没有全基因组进行基因编辑是行不通的对吗?

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3楼2021-09-07 16:09:31
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liqi2589

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问敲除成功了吗?

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4楼2023-11-22 19:21:37
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