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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » Autodock分子对接问题
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linhuikang

新虫 (初入文坛)

[交流] Autodock分子对接问题 已有4人参与

大家好，我使用autodock vina进行分子对接，随后使用pymol进行可视化处理，发现两个软件显示的氢键数量有所不同，pymol会多上1-2个氢键，请问这是什么原因呢？

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1楼 2021-08-04 10:29:24
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GYHandJXY

新虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，您的问题解决了吗 我的是pymol少氢键

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8楼2023-07-03 08:15:24
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匿名

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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linhuikang
2楼2021-08-04 10:51:08
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linhuikang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hupojy33 at 2021-08-04 10:51:08
两个软件判断氢键的标准不一样，你可以看一下，多出来氢键是否真的存在

十分感谢您的回复，请问我在pymol上如何判断是否真的为氢键呢？以下是我pymol处理的对接图，还请您指教！

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3楼2021-08-04 12:51:19
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linhuikang

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by hupojy33 at 2021-08-04 10:51:08
两个软件判断氢键的标准不一样，你可以看一下，多出来氢键是否真的存在

抱歉，图片好像发不出来，您可以指教一下判断方法吗？

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4楼2021-08-04 12:53:58
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