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linhuikang

新虫 (初入文坛)

[交流] Autodock分子对接问题 已有4人参与

大家好,我使用autodock vina进行分子对接,随后使用pymol进行可视化处理,发现两个软件显示的氢键数量有所不同,pymol会多上1-2个氢键,请问这是什么原因呢?

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linhuikang

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:
2楼: Originally posted by hupojy33 at 2021-08-04 10:51:08
两个软件判断氢键的标准不一样,你可以看一下,多出来氢键是否真的存在

抱歉,图片好像发不出来,您可以指教一下判断方法吗?

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4楼2021-08-04 12:53:58
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匿名

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2楼2021-08-04 10:51:08
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linhuikang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hupojy33 at 2021-08-04 10:51:08
两个软件判断氢键的标准不一样,你可以看一下,多出来氢键是否真的存在

十分感谢您的回复,请问我在pymol上如何判断是否真的为氢键呢?以下是我pymol处理的对接图,还请您指教!

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3楼2021-08-04 12:51:19
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匿名

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼2021-08-04 15:42:14
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