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MD simulation之后处理ovito中遇到的问题
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前辈们，朋友们： 你们好！ 我的研究方向是采用分子动力学模拟硬脆性材料在纳米加工中的材料去除机理及变形行为。最近在采用ovito尝试对模拟结果进行后处理时，出现了一些问题不知如何解决，特别希望热心的虫友可以为我释惑。问题如下： 1、在ovito中进行配位数分析，在视觉效果上感觉配位数设置无误后（截断半径我设置为稍大于键长）， 进行成键时却发现配位数与中心原子的键数十分不一致，如5配位原子的中心原子键数应为5才对，但键数却表现的极为任意（0~5个），原子间没有键居多，成5键的原子几乎没有，真的很奇怪； 2、在SiC材料中，在Si原子和C原子成键时，C原子和C原子、Si原子和Si原子之间是否会成键呢？ 先行感谢致力于研究的你们，盼解惑！ 一个在分子动力学上处于迷茫的人儿 |
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HJieY2楼2021-07-27 19:12:15
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6楼2021-07-29 19:46:57
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8楼2021-07-29 23:20:40
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