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navypang

金虫 (正式写手)

[交流] 如何获得氢键的偏差

如何获得氢键的偏差?下图中画黄的数字!请高手指点,谢谢!

[ Last edited by navypang on 2009-8-17 at 08:46 ]
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lordxb


navypang(金币+1,VIP+0):谢谢,我只能找到D。。。A的偏差,其他的我没找到呀。 8-17 09:28
可以在LST文件里面找了。
2楼2009-08-17 09:15:15
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navypang

金虫 (正式写手)

我只能找到D。。。A的偏差,其他的我没找到呀。
3楼2009-08-17 09:27:39
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
navypang(金币+14,VIP+0): 8-17 19:55
如果H没有修正,就没有除D...A外的偏差. 这没有关系的.
xi2004-emuch@163.com
4楼2009-08-17 10:33:52
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navypang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-8-17 10:33:
如果H没有修正,就没有除D...A外的偏差. 这没有关系的.

Comment 1): How were hydrogen atoms located? How were their positions refined (there are no s.u.'s in the cif given)?
Response: The hydrogen atoms on the water molecules were positioned from difference Fourier maps and fixed in the refinement.
Comment 2): In Table 1, s.u.'s should be given, where available (definitely for D...A) and the other data should be rounded to expected precision, i.e. to 2 decimal digits for D-H and H...A distances and to integers for D-H...A angles.
Response: According to the comment, we have add the s.u.'s for D...A to the table 1. However, because the hydrogen atoms on the water molecules were refined by fixed model, no s.u.'s were given for D-H/H...A distances and D-H...A angles
谢谢xi2004老师。您帮我看看这样回答可以吗?
5楼2009-08-17 19:55:35
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
navypang(金币+5,VIP+0):再次谢谢谢谢xi2004老师,谢谢您多次热情的帮助。 8-18 08:20
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-27 09:20
差不多, 注意一下语法.

另外,最好很具体说明一下H是如何被对待的, 这个参考别人的文章就可以了,很多的.

不要笼统地说 "fixed in the refinement" 比如是不是用了-1.5, -1.2? 是不是首先从D-Fourier map 找到, 然后再固定O-H键长为0.85? 最后是用了AFIX 的constraint? 这些要一一说明.
xi2004-emuch@163.com
6楼2009-08-17 22:16:50
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