24小时热门版块排行榜    

查看: 813  |  回复: 1
【悬赏金币】回答本帖问题,作者DOONWOON将赠送您 5 个金币

DOONWOON

新虫 (初入文坛)

[求助] 请大家帮帮我,我模拟的msd有问题

大家好,我模拟的msd为什么别文献差距很大呢,别人的一百万步和我的一百万步差了几十倍,in文件和data文件是一样的,我只是改了一下在nvt下面模拟,究竟是哪里出了问题呢,下面是我的in文件和我模拟出来的数据,别人都是1000左右,我跑一百万步才25
fix                             npt all npt temp $t $t 100 aniso 1 1 100
run                           200000
unfix                        npt

fix                             nvt all nvt temp $t $t 100
run                           200000
unfix                        nvt

reset_timestep       0

fix                             nvt all nvt temp $t $t 100


group                      na_group type 3
group                      k_group type 2
group                      co_group type 1 4
group                      mol molecule 1

compute                3 na_group msd
fix                            3 na_group ave/time   10 100 1000 c_3[4] c_3[1] c_3[2] c_3[3] file na_group.msd

compute                 4 co_group msd
fix                            4 co_group ave/time   10 100 1000 c_4[4] c_4[1] c_4[2] c_4[3] file co_group.msd

compute                 5 mol msd
fix                             5 mol ave/time   10 100 1000 c_5[4] c_5[1] c_5[2] c_5[3] file mol_group.msd

compute                6 k_group msd
fix                            6  k_group ave/time   10 100 1000 c_6[4] c_6[1] c_6[2] c_6[3] file k_group.msd

run                                  1000000

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DOONWOON

新虫 (初入文坛)

2楼2021-07-14 18:06:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 DOONWOON 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 复试调剂 +5 Copy267 2026-03-10 5/250 2026-03-12 20:32 by peike
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-12 7/350 2026-03-12 20:31 by peike
[考研] 纺织、生物、化学、材料相关专业招生了 +4 耶耶业 2026-03-09 7/350 2026-03-12 19:05 by Equinoxhua
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +9 11啦啦啦 2026-03-11 10/500 2026-03-12 17:15 by 11啦啦啦
[考研] 285求调剂 +3 柴郡猫_ 2026-03-12 3/150 2026-03-12 15:39 by 布丁aaa
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +5 ZyZy…… 2026-03-10 5/250 2026-03-12 11:31 by 2020015
[考研] 277求调剂 +3 anchor17 2026-03-12 3/150 2026-03-12 08:43 by 学员8dgXkO
[考研] 334求调剂 +3 mjqzz 2026-03-06 3/150 2026-03-11 20:38 by 清风月
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +9 我想读研11 2026-03-10 9/450 2026-03-11 16:42 by 看开一点
[考研] 泣血叩求调剂恩,愿以丹心报师恩 +5 Iuruoh 2026-03-11 5/250 2026-03-11 16:19 by 暖阳芬芳
[考研] 293求调剂,一志愿陕师大生物学 +3 ??????.?.??? 2026-03-09 3/150 2026-03-11 10:02 by 学员8dgXkO
[考研] 调剂的同学,走过路过,不要错过 +11 likeihood 2026-03-06 16/800 2026-03-10 11:38 by Djdjj12
[考研] 环境调剂 +5 晓看天暮看云 2026-03-09 5/250 2026-03-10 10:46 by 星空星月
[考研] 化工284求调剂 +12 小黑想变白 2026-03-07 12/600 2026-03-10 09:17 by Wahxp
[考研] 一志愿山东大学,总分327,英语二79,有论文,有竞赛,已过四六级 +3 木木目目1 2026-03-09 3/150 2026-03-09 19:52 by yuningshan
[考研] 296求调剂 +4 Xinyu Wu311 2026-03-09 4/200 2026-03-09 11:51 by 勇敢太监王公公
[考研] 0856材料与化工290求调剂 +7 Nebulala 2026-03-08 8/400 2026-03-09 05:25 by houyaoxu
[考研] 083000环境科学与工程调剂 +5 加油呀fxy 2026-03-07 6/300 2026-03-08 21:07 by sdgdsdgd
[考研] 276求调剂 本科天津工业大学 一志愿北京化工大学0855 +4 路lyh123 2026-03-06 6/300 2026-03-07 11:37 by shdliugang
信息提示
请填处理意见