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请大家帮帮我,我模拟的msd有问题
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大家好,我模拟的msd为什么别文献差距很大呢,别人的一百万步和我的一百万步差了几十倍,in文件和data文件是一样的,我只是改了一下在nvt下面模拟,究竟是哪里出了问题呢,下面是我的in文件和我模拟出来的数据,别人都是1000左右,我跑一百万步才25 fix npt all npt temp $t $t 100 aniso 1 1 100 run 200000 unfix npt fix nvt all nvt temp $t $t 100 run 200000 unfix nvt reset_timestep 0 fix nvt all nvt temp $t $t 100 group na_group type 3 group k_group type 2 group co_group type 1 4 group mol molecule 1 compute 3 na_group msd fix 3 na_group ave/time 10 100 1000 c_3[4] c_3[1] c_3[2] c_3[3] file na_group.msd compute 4 co_group msd fix 4 co_group ave/time 10 100 1000 c_4[4] c_4[1] c_4[2] c_4[3] file co_group.msd compute 5 mol msd fix 5 mol ave/time 10 100 1000 c_5[4] c_5[1] c_5[2] c_5[3] file mol_group.msd compute 6 k_group msd fix 6 k_group ave/time 10 100 1000 c_6[4] c_6[1] c_6[2] c_6[3] file k_group.msd run 1000000 发自小木虫IOS客户端 |
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