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DOONWOON

新虫 (初入文坛)

[求助] 请大家帮帮我,我模拟的msd有问题

大家好,我模拟的msd为什么别文献差距很大呢,别人的一百万步和我的一百万步差了几十倍,in文件和data文件是一样的,我只是改了一下在nvt下面模拟,究竟是哪里出了问题呢,下面是我的in文件和我模拟出来的数据,别人都是1000左右,我跑一百万步才25
fix                             npt all npt temp $t $t 100 aniso 1 1 100
run                           200000
unfix                        npt

fix                             nvt all nvt temp $t $t 100
run                           200000
unfix                        nvt

reset_timestep       0

fix                             nvt all nvt temp $t $t 100


group                      na_group type 3
group                      k_group type 2
group                      co_group type 1 4
group                      mol molecule 1

compute                3 na_group msd
fix                            3 na_group ave/time   10 100 1000 c_3[4] c_3[1] c_3[2] c_3[3] file na_group.msd

compute                 4 co_group msd
fix                            4 co_group ave/time   10 100 1000 c_4[4] c_4[1] c_4[2] c_4[3] file co_group.msd

compute                 5 mol msd
fix                             5 mol ave/time   10 100 1000 c_5[4] c_5[1] c_5[2] c_5[3] file mol_group.msd

compute                6 k_group msd
fix                            6  k_group ave/time   10 100 1000 c_6[4] c_6[1] c_6[2] c_6[3] file k_group.msd

run                                  1000000

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DOONWOON

新虫 (初入文坛)

2楼2021-07-14 18:06:06
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