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有用过BPROM预测启动子的小伙伴吗
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有用过BPROM预测原核生物启动子的小伙伴吗？预测结果看不懂啊，预测应该放多少bp的碱基进行预测呢，还要这个预测结果什么意思 Length of sequence- 315 Threshold for promoters - 0.20 Number of predicted promoters - 1 Promoter Pos: 108 LDF- 14.49 -10 box at pos. 93 GTCTAGTA> Score 47 -35 box at pos. 76 TTGCAG Score 49 Oligonucleotides from known TF binding sites: For promoter at 108: rpoD17: ATTTTGTA at position 51 Score - 9 rpoD15: TTTTGTAA at position 52 Score - 11 tus: TAGTATGT at position 96 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 103 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 104 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 105 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 106 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 107 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 108 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 109 Score - 16 rpoH2: TTTTTTTT at position 110 Score - 16 |
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Jianxiao_H
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