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黎明之前01

新虫 (初入文坛)

[求助] 载体测序无信号是怎么回事? 已有1人参与

我之前用Infusion的方法连接不上,总是连上了两端,中间缺失。然后我就换用T4连接的方法,先连接在T载体上,然后进行菌液PCR,条带正确,提了质粒,双酶切,胶回收后用于T4连接到我的骨架载体上,再进行菌液PCR,条带正确,送菌液测序无信号,然后自己提了质粒去测序也无信号,这是什么原因呢?

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黎明之前01

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2021-06-01 17:25:52
1、楼主首先要确认挑选的克隆是正确的克隆,菌液pcr验证正确,应该提取质粒,并进行双酶切验证是否真的为阳性克隆。

2、菌液和质粒均没有信号,是不是载体拷贝数较低,楼主提取质粒后有没有进行电泳检测,确认载 ...

感谢回复,受益良多
我已进行过双酶切验证,是正确的
载体浓度比较低 t载体质粒小提浓度大概60ng
T4连接以后小提浓度大概120ng
由于T载体浓度比较低,不好测序,我打算用你说的最后一种方法看看,感谢!

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3楼2021-06-01 18:10:49
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1、楼主首先要确认挑选的克隆是正确的克隆,菌液pcr验证正确,应该提取质粒,并进行双酶切验证是否真的为阳性克隆。

2、菌液和质粒均没有信号,是不是载体拷贝数较低,楼主提取质粒后有没有进行电泳检测,确认载体浓度高低。

3、测序没有信号,和测序为空载还是两个不同的问题,一方面与载体浓度有关,另一方面楼主要确认选择的测序引物是否合适。

4、有可能测序供公司问题。

解决办法:

      1、因为不清楚楼主使用的框架载体是什么载体,是否有通用引物?
   
       其实楼主可以在构建好T克隆后就进行测序(T载体本身就经常被用来做亚克隆测序),T载体有自己的通用引物,发生没信号的概率比较低。因为你后续是进行酶切亚克隆的,不存在PCR的过程(PCR过程可能导致错配或突变等情况,所以一般要测序验证),发生目标基因突变的可能性较低,即T载体克隆阶段测序结果可以作为你亚克隆后的测序结果(结合双酶切验证结果)。

     2、楼主也可以提取重组质粒,并进行双酶切验证,酶切确定为正确的质粒,且质粒浓度OK,可将该质粒作为样品送测序。
     
     同时如果确认之前选择的引物没有问题,那么本次可以尝试寄送 自己的引物作为测序引物,比如你菌落PCR用的引物就可以作为测序用。

     3、如果上述方法没办法解决,可以用你的引物对挑选的克隆进行pcr,然后胶回收你的目的条带,将这个回收PCR产物和你自己的引物一同送去测序。

     方法还是比困难多,祝好1
天空才是极限,我有信心飞的更高!
2楼2021-06-01 17:25:52
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